RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCF1Q9UBD9 225 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 GHRLQ9UBU3 117 aa22.81■■□□□ 1.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 LAP3P28838 519 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1C2P52895 323 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1C1Q04828 323 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf57Q99622 126 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 SRXN1Q9BYN0 137 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A7Q9GZV3 580 aa22.8■■□□□ 1.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 CDC14BO60729 498 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 AKR1D1P51857 326 aa22.8■■□□□ 1.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM59Q9BXS4 323 aa22.8■■□□□ 1.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 IL15RAQ13261 267 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 POC1AQ8NBT0 407 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 RND1Q92730 232 aa22.78■■□□□ 1.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa22.77■■□□□ 1.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 PLAC9Q5JTB6 97 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM211Q6ICI0 200 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa22.77■■□□□ 1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa22.76■■□□□ 1.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN1O95832 211 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 CST4P01036 141 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 AMY2BP19961 511 aa22.76■■□□□ 1.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10S1Q8NGN2 331 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF9BQ9HBM6 251 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SMCO4Q9NRQ5 59 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 SERINC1Q9NRX5 453 aa22.76■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5AC2Q9NZP5 309 aa22.76■■□□□ 1.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 LIPT2A6NK58 231 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 CD5P06127 495 aa22.75■■□□□ 1.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 MEOX2P50222 304 aa22.75■■□□□ 1.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 TIMP3P35625 211 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 F2RL1P55085 397 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 BIDP55957 195 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 MYBPHQ13203 477 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM200AQ86VY9 491 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 COMMD1Q8N668 190 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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