RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc107Q9DCC3 242 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Acox3Q9EPL9 700 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm4881A0A140LIR9 352 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr110A2RT31 317 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn2r66K7N6R9 851 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hspb1P14602 209 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc38a8Q5HZH7 432 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pafah1b3Q61205 232 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Taf9bQ6NZA9 249 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sema6dQ76KF0 1073 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr111Q7TRK1 317 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adgrg7Q8BM96 785 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PaxxQ8K0Y7 205 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Glyr1Q922P9 546 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prss28Q924N9 274 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm21149A0A0G2JFY7 255 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1511E9PWU0 318 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1510E9PZZ6 318 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm12830F6XVH0 157 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MgllO35678 303 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Npbwr1P49681 329 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 B3gat2P59270 324 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fabp5Q05816 135 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcnx2Q5DU28 2122 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CapslQ6P8Y1 208 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rab9bQ8BHH2 201 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Akr1c18Q8K023 323 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr678Q8VG26 313 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Spef1Q99JL1 234 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rtl8bQ9D1F0 113 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tob1Q61471 362 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr598Q7TRR2 319 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adam30Q811Q3 732 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 C330021F23RikQ8C7T0 141 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam199xQ8K2D0 388 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znhit1Q8R331 154 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r51Q8VIC6 319 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CrtapQ9CYD3 400 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 C1galt1Q9JJ06 363 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Htr6Q9R1C8 440 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Stub1Q9WUD1 304 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ubl3Q9Z2M6 117 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 D7Ertd443eD2J0Y4 644 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr225E9PWF9 419 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smim22J3QP37 91 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prss39O70169 367 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adra2aQ01338 450 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sec24bQ80ZX0 1251 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm16503Q8C6M9 103 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Scgb2b27Q8R1E9 112 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1392Q8VFA6 311 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1260Q8VGN9 310 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arfgap3Q9D8S3 523 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 1700013G24RikQ9DAC6 286 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Alg5Q9DB25 324 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm28897A0A087WP44 222 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igkv14-111A0A140T8P9 117 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Klri1B2KG20 248 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pnliprp2P17892 482 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Il18P70380 192 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GalnsQ571E4 520 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam117aQ7TNF9 451 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1061Q7TR72 313 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hapln4Q80WM4 400 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kiaa1456Q80WQ4 447 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gtdc1Q8BW56 445 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gtf3aQ8VHT7 364 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plxdc1Q91ZV7 500 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prkar1aQ9DBC7 381 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ApooQ9DCZ4 198 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 G6pc2Q9Z186 355 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rpl7a-ps5A0A140T8L3 268 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp69A2A761 587 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Abcd4O89016 606 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mtnd4lP03903 98 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 RelbQ04863 558 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10912Q3UXH0 145 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp955aQ80XR7 545 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1230Q8VG58 305 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Thyn1Q91YJ3 226 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zcchc12Q9CZA5 402 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q9D8N1 392 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 S1pr3Q9Z0U9 378 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Igkv5-37A0A140T8N4 115 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ptpn20O55082 426 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nipsnap1O55125 284 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wnt5aP22725 380 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Samd12Q0VE29 161 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1442Q0VEV7 312 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr125Q14AJ9 320 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vax1Q2NKI2 338 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mef2aQ60929 498 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Alkbh2Q6P6J4 239 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10277Q6R5C6 214 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Phf21aQ6ZPK0 659 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wdfy2Q8BUB4 400 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trmt6Q8CE96 497 aa11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.6 ms