RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 WIPI2Q9Y4P8 454 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0B4J203 849 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JMP0 313 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0X1KG70 313 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 J3QLI3 93 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 LDLRAD4O15165 306 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CTDSPLO15194 276 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKACBP22694 351 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 UBA52P62987 128 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CLVS2Q5SYC1 327 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 LYSMD2Q8IV50 215 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CMTM4Q8IZR5 234 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 JAGN1Q8N5M9 183 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX29Q8N6K0 151 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4M2Q8NGB6 313 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4M1Q8NGD0 313 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A38Q96DW6 304 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF747Q9BV97 191 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0A6YYH2 397 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 A6NJ64 397 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 UBBP0CG47 229 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ARSBP15848 533 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB6AP20340 208 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ACKR3P25106 362 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN12P56749 244 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS21Q2M5E4 152 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PCGF3Q3KNV8 242 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 MINDY2Q8NBR6 621 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2AE1Q8NHA4 323 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNPRQ8TBG9 265 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SETD6Q8TBK2 473 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 OR51B6Q9H340 312 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RHBDL2Q9NX52 303 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 STARD10Q9Y365 291 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 BPNT1O95861 308 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 FAHP16930 419 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNOP22674 350 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 POU3F4P49335 361 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 IL18Q14116 193 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2V2Q15819 145 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM189A2Q15884 450 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PYDC2Q56P42 97 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 HACD4Q5VWC8 232 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTD2Q9H8S5 307 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GMDSO60547 372 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CST4P01036 141 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 HLA-DQB1P01920 261 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT5AP41221 380 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXW12Q6X9E4 464 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 FTMTQ8N4E7 242 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 NANPQ8TBE9 248 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CHPT1Q8WUD6 406 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 C22orf15Q8WYQ4 148 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB39BQ96DA2 213 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH20Q9HBT6 801 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 A6NIN4 97 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP15P51511 669 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 UCP2P55851 309 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFA1P59665 94 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFA3P59666 94 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN1BQ07699 218 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RY14Q15391 338 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF12L2Q5VW00 463 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 STEAP3Q658P3 488 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4D6Q8NGJ1 314 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB22AQ9UL26 194 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 VWFP04275 2813 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 XRCC3O43542 346 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 NRASP01111 189 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 NGFP01138 241 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-13P01766 116 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 HKR1P10072 659 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 IL7P13232 177 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 QRFPP83859 136 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 KISS1Q15726 138 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 BAK1Q16611 211 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 Q8N402 240 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD1Q96SE0 405 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 DIABLOQ9NR28 239 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIAL4AQ9Y536 164 aa20.21■□□□□ 0.83
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