RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	F2RL2	O00254	374 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	DLGAP1	O14490	977 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	XPNPEP2	O43895	674 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	MMP23A	O75900	390 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	APOL3	O95236	402 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	IGHA1	P01876	353 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	CD33	P20138	364 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	CALB2	P22676	271 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	DAP	P51397	102 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	OR12D2	P58182	307 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	SSX6	Q7RTT6	188 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	TCF23	Q7RTU1	214 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078		Q8N2B8	174 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	OR4F4	Q96R69	305 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078		R4GMQ9	66 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	ATP8B1	O43520	1251 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	FKBP6	O75344	327 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF737	O75373	536 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	CHRM2	P08172	466 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	EPHA2	P29317	976 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	GK3P	Q14409	553 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	UBE2V2	Q15819	145 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF626	Q68DY1	528 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF714	Q96N38	554 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TCF4-262	ENST00000628078	AQP12B	A6NM10	295 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	GABRR1	P24046	479 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	MPZ	P25189	248 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	NPBWR2	P48146	333 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	IL24	Q13007	206 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	RDH10	Q8IZV5	341 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	DTX3	Q8N9I9	347 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	CEP19	Q96LK0	163 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ING3	Q9NXR8	418 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SYT7	O43581	403 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	LPL	P06858	475 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PF4V1	P10720	104 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ACTR3	P61158	418 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	FLOT2	Q14254	428 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	GRK1	Q15835	563 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	STMN2	Q93045	179 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SNX22	Q96L94	193 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PKIB	Q9C010	78 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	10.82	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	hADV38S2	A0JD32	116 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078		K7EIL1	84 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SIRPB1	O00241	398 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PSPN	O60542	156 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	HAND1	O96004	215 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	BCL3	P20749	454 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	POU3F4	P49335	361 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	CD83	Q01151	205 aa		10.81	□□□□□ -0.68

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