RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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SGMS1-210ENST00000619438 PIGLQ9Y2B2 252 aa18.49■□□□□ 0.55
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF587BE7ETH6 402 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-210ENST00000619438 H3BUI4 141 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-210ENST00000619438 SSX5O60225 188 aa18.48■□□□□ 0.55
SGMS1-210ENST00000619438 RGS11O94810 467 aa18.48■□□□□ 0.55
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SGMS1-210ENST00000619438 NINJ1Q92982 152 aa18.48■□□□□ 0.55
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SGMS1-210ENST00000619438 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
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SGMS1-210ENST00000619438 VAX1Q5SQQ9 334 aa18.44■□□□□ 0.54
SGMS1-210ENST00000619438 CLVS2Q5SYC1 327 aa18.44■□□□□ 0.54
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM42Q69YG0 159 aa18.44■□□□□ 0.54
SGMS1-210ENST00000619438 C1QL2Q7Z5L3 287 aa18.44■□□□□ 0.54
SGMS1-210ENST00000619438 SLC25A42Q86VD7 318 aa18.44■□□□□ 0.54
SGMS1-210ENST00000619438 C17orf78Q8N4C9 275 aa18.44■□□□□ 0.54
SGMS1-210ENST00000619438 FTMTQ8N4E7 242 aa18.44■□□□□ 0.54
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