RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF626	Q68DY1	528 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	NEU1	Q99519	415 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	MED6	O75586	246 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	NDUFB6	O95139	128 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	SIX6	O95475	246 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	CD8A	P01732	235 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	IGHG1	P01857	330 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	CD14	P08571	375 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	TACSTD2	P09758	323 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP5J2	P56134	94 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAB1A	P62820	205 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM122B	Q7Z309	247 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPIC	Q8N5J4	248 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR6X1	Q8NH79	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM106A	Q96A25	262 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	SYT4	Q9H2B2	425 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RABGEF1-209	ENST00000607882	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ARPC5	O15511	151 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	DHH	O43323	396 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SGCE	O43556	437 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	RLN1	P04808	185 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACSM4	P0C7M7	580 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNK15	Q9H427	330 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABHD16A	O95870	558 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ERVS71-1	P61550	626 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TESK1	Q15569	626 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MEP1B	Q16820	701 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MEST	Q5EB52	335 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	WDR76	Q9H967	626 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882		A0A1W2PN81	502 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	DANCR	P0C864	163 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SDHA	P31040	664 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	CHRNA7	P36544	502 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	FABP6	P51161	128 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	EFNB2	P52799	333 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRSS12	P56730	875 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	RAP2B	P61225	183 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MSMP	Q1L6U9	139 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882		Q96MF0	132 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ETV7	Q9Y603	341 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATR	Q13535	2644 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TEX46	H3BTG2	121 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LY86	O95711	162 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	CTLA4	P16410	223 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	LAP3	P28838	519 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	NAAA	Q02083	359 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZP4	Q12836	540 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	MUC15	Q8N387	334 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM54	Q969K7	222 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RABGEF1-209	ENST00000607882	TXN2	Q99757	166 aa		10.76	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 236.3 ms