RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602498.1

HCG18-243, Transcript of HLA complex group 18, human

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 327 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCG18-243	ENST00000602498	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RFK	Q969G6	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	MNT	Q99583	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SSX3	Q99909	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	USE1	Q9NZ43	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		J3QRE1	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		M0R1W7	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	EBAG9	O00559	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PSPN	O60542	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SULT1C4	O75897	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	MMP23A	O75900	390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SERPINA3	P01011	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GABRB1	P18505	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CD24	P25063	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	UBE2E1	P51965	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FUT6	P51993	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ATP1B3	P54709	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	BPIFB3	P59826	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IL24	Q13007	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GRK1	Q15835	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LTC4S	Q16873	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	UTF1	Q5T230	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TREML4	Q6UXN2	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	APH1B	Q8WW43	257 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DYRK2	Q92630	601 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RASL12	Q9NYN1	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DYSF	O75923	2080 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		A0A1W2PPK0	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		K7N7A8	449 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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