RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	RORB	Q92753	470 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	SNX22	Q96L94	193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-208	ENST00000579743		A0A0G2JK05	382 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743		A6NIN4	97 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SNTN	A6NMZ2	147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743		M0R129	80 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	TSPAN15	O95858	294 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ALDOB	P05062	364 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CCL3L1	P16619	93 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	PRKACB	P22694	351 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	RBP2	P50120	134 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	EFNB2	P52799	333 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ERVK11-1	P61568	191 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ZSCAN26	Q16670	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OR8H2	Q8N162	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF714	Q96N38	554 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CHST5	Q9GZS9	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	GNG8	Q9UK08	70 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	FUOM	A2VDF0	154 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF20	P17024	532 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	GABRR1	P24046	479 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	BMX	P51813	675 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ACTC1	P68032	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ACTA1	P68133	377 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	BNIP1	Q12981	228 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF273	Q14593	569 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	BATF2	Q8N1L9	274 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	C17orf50	Q8WW18	174 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SLAMF9	Q96A28	289 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CIB1	Q99828	191 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	F2RL2	O00254	374 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	INMT	O95050	263 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	EPHA2	P29317	976 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	MTCP1	P56278	107 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	IL18R1	Q13478	541 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	UBE2V2	Q15819	145 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	GRK1	Q15835	563 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SSX2	Q16385	188 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	DAPL1	A0PJW8	107 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743		H3BSH0	61 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SH2D1B	O14796	132 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	XPNPEP2	O43895	674 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	HAND1	O96004	215 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OPN1MW	P04001	364 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	POU3F4	P49335	361 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF626	Q68DY1	528 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.11	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms