RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM186Q96B77 213 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF222Q9UK12 451 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEGF11A6BM72 1044 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX6-3A6NJ46 265 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL6IP5O75915 188 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 KNG1P01042 644 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRMP19623 302 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLCCI1Q86VQ1 547 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 LURAP1LQ8IV03 231 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH26Q8IXH8 852 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV20A0A0B4J274 112 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFPL4AA6NLU0 287 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q71RC1 249 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM192AQ9GZU8 254 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 YAE1D1Q9NRH1 226 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 HIF1ANQ9NWT6 349 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNS2Q9ULS6 477 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 WNK2Q9Y3S1 2297 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALP22466 123 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTGFRP43088 359 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABRA2P47869 451 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM58AQ8N1B3 248 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM216BQ8N7L0 139 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 MUL1Q969V5 352 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED30Q96HR3 178 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAFA1Q96PS6 74 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLITRK2Q9H156 845 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 A8MV72 311 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR3A4PP47883 348 aa27.54■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL13RA1P78552 427 aa27.54■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GW55 424 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM64CA6NLI5 447 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DVL1O14640 695 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIGLEC5O15389 551 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SFTPBP07988 381 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUX4L2P0CJ85 424 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUX4L3P0CJ86 424 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUX4L4P0CJ87 422 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUX4L5P0CJ88 424 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUX4L6P0CJ89 424 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUX4L7P0CJ90 424 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1QL2Q7Z5L3 287 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 JAGN1Q8N5M9 183 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDSLQ96GA7 329 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUX4Q9UBX2 424 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR14J1Q9UGF5 321 aa27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SONP18583 2426 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa27.52■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFF1P04155 84 aa27.52■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADRA2CP18825 462 aa27.52■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDX2P32119 198 aa27.52■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASCL4Q6XD76 172 aa27.52■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRTM1Q86UE6 522 aa27.52■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMG20AQ9NP66 347 aa27.52■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5V1Q9UGF6 321 aa27.52■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFB3O43676 98 aa27.51■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKACAP17612 351 aa27.51■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 CALRP27797 417 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC10Q5BKY1 277 aa27.51■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYPD6Q86Y78 171 aa27.51■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAB21L2Q9Y586 359 aa27.51■■■□□ 2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCN3O75636 299 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 IKZF1Q13422 519 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF146Q15072 292 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPIN3Q5JUX0 258 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF561Q8N587 486 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD177Q8N6Q3 437 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A13Q99584 98 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 UQCC2Q9BRT2 126 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNTD2Q9H8S5 307 aa27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATA3P23771 443 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 BMXP51813 675 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSU1Q15404 277 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 DGUOKQ16854 277 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf91Q3C1V1 193 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLT8D1Q68CQ7 371 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELP2Q6IA86 826 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNRF1Q8ND25 227 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL36GQ9NZH8 169 aa27.5■■□□□ 1.99
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL36RNQ9UBH0 155 aa27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms