RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM235	A6NFC5	223 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TOR1A	O14656	332 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	COX5A	P20674	150 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PSMB6	P28072	239 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OR3A4P	P47883	348 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF92	Q03936	586 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	GNMT	Q14749	295 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TMUB2	Q71RG4	321 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FAM219A	Q8IW50	185 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF524	Q96C55	264 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	NICN1	Q9BSH3	213 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	GSX2	Q9BZM3	304 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	GPR173	Q9NS66	373 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PLSCR5	A0PG75	271 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FAH	P16930	419 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	DUSP1	P28562	367 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TCEAL3	Q969E4	200 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	C5orf51	A6NDU8	294 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CD300LB	A8K4G0	201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FAM166B	A8MTA8	275 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TRDC	B7Z8K6	153 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	KITLG	P21583	273 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	HRH1	P35367	487 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	DHRS2	Q13268	280 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ODF1	Q14990	250 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1B0GTH9	108 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667		E5RGE8	158 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OR8G1	Q15617	311 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MTFR2	Q6P444	385 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	STOML3	Q8TAV4	291 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	LYZL4	Q96KX0	146 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM100	Q9NV29	134 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	NSG2	Q9Y328	171 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CACNA1E	Q15878	2313 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	M6PR	P20645	277 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PPP1CB	P62140	327 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	MOB3A	Q96BX8	217 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	RNF150	Q9ULK6	438 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	GPR31	O00270	319 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	GOSR1	O95249	250 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	EFNB2	P52799	333 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CATR1	Q13166	79 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SSX2	Q16385	188 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF546	Q86UE3	836 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	SLC6A7	Q99884	636 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	NAA60	Q9H7X0	242 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	NUP50	Q9UKX7	468 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667		A0A0B4J293	547 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	C5orf49	A4QMS7	147 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-233	ENST00000557667	HSPA12A	O43301	675 aa		7.35	□□□□□ -1.23

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