RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	GABRA2	P47869	451 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	GPM6A	P51674	278 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	OR12D2	P58182	307 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ACTC1	P68032	377 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ACTA1	P68133	377 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF85	Q03923	595 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	MAB21L1	Q13394	359 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	TMED1	Q13445	227 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	MED21	Q13503	144 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	LIPN	Q5VXI9	398 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SATL1	Q86VE3	508 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	BATF2	Q8N1L9	274 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	STX19	Q8N4C7	294 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SPERT	Q8NA61	448 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SETD9	Q8NE22	299 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB39B	Q96DA2	213 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	LGALS12	Q96DT0	336 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	C4orf36	Q96KX1	117 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288		R4GMQ9	66 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	HIVEP2	P31629	2446 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	IFNL4	K9M1U5	179 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	CDIPT	O14735	213 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	AKR7A2	O43488	359 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM20	O43506	726 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	RP2	O75695	350 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SULT1C4	O75897	302 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	TTR	P02766	147 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	MYL12A	P19105	171 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ACKR3	P25106	362 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	CAPG	P40121	348 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	CAPZA1	P52907	286 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	LMO4	P61968	165 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	BTG1	P62324	171 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	GNB2	P62879	340 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	CSNK2B	P67870	215 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SCN1B	Q07699	218 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ZMYND11	Q15326	602 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ESCO2	Q56NI9	601 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF691	Q5VV52	312 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	KLB	Q86Z14	1044 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SPIC	Q8N5J4	248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-238	ENST00000556288	OR51F2	Q8NH61	342 aa		3.88	□□□□□ -1.79

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