RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	FOXA1	P55317	472 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MELK	Q14680	651 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TIGIT	Q495A1	244 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GJC3	Q8NFK1	279 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	DOK4	Q8TEW6	326 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PSMF1	Q92530	271 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		Q96MF0	132 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MGLL	Q99685	303 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GABRG3	Q99928	467 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM235	A6NFC5	223 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		E9PLN8	166 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FCN1	O00602	326 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GRAP2	O75791	330 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	KNG1	P01042	644 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SPINK8	P0C7L1	97 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SHC1	P29353	583 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FZD2	Q14332	565 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MEF2D	Q14814	521 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MORN2	Q502X0	79 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CGB2	Q6NT52	195 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM64	Q6YI46	380 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF605	Q86T29	641 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	C1QL4	Q86Z23	238 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	STPG4	Q8N801	248 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MALSU1	Q96EH3	234 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CSF3R	Q99062	836 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PTPRJ	Q12913	1337 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A0J9YY10	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1B0GX78	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CLDN11	O75508	207 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MOS	P00540	346 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HTR1E	P28566	365 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MEOX1	P50221	254 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SPHAR	Q15513	63 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MMD	Q15546	238 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2L13	Q8N349	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2T12	Q8NG77	320 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	EBPL	Q9BY08	206 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GKN1	Q9NS71	199 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		A0A1W2PS29	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	FGF17	O60258	216 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NDUFA7	O95182	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LAMP1	P11279	417 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GCSH	P23434	173 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MIP	P30301	263 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GZMM	P51124	257 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LTB	Q06643	244 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MIIP	Q5JXC2	388 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2T29	Q8NH02	315 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RNF138	Q8WVD3	245 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TMED6	Q8WW62	240 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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