RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OR7C2O60412 319 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PNV4 684 aa7.53□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 STUMQ69YW2 141 aa7.52□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
PTPRB-208ENST00000550358 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 SSX9Q7RTT3 188 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF561Q8N587 486 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 CHST5Q9GZS9 411 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.51□□□□□ -1.21
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