RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 CHST5Q9GZS9 411 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.55□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BNX3 289 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 PSPNO60542 156 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP5HO75947 161 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ALPLP05186 524 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 CHRM2P08172 466 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF728P0DKX0 622 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 PIPP12273 146 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 FCGR1AP12314 374 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 COX7A1P24310 79 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 GABRA5P31644 462 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 TP53I3Q53FA7 332 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 FDX2Q6P4F2 183 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC54Q8NEL0 328 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 SLAMF9Q96A28 289 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 CEP19Q96LK0 163 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF649Q9BS31 505 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 AASSQ9UDR5 926 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC7A11Q9UPY5 501 aa9.54□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 A6NDX4 124 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ENTPD6O75354 484 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 MMP23AO75900 390 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 INMTO95050 263 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHA1P01876 353 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 RBP4P02753 201 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ISG15P05161 165 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 GABRB1P18505 474 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 RASSF2P50749 326 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 OR12D2P58182 307 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 HERPUD1Q15011 391 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF626Q68DY1 528 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZS46 218 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 OR8H2Q8N162 312 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8N2B8 174 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 C10orf35Q96D05 121 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 MALSU1Q96EH3 234 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 SNX22Q96L94 193 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 MBOAT4Q96T53 435 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF702PQ9H963 129 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.53□□□□□ -0.88
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PPH5 198 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV1D-12P01611 117 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 CALCBP10092 127 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 ATF1P18846 271 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 BCL3P20749 454 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 DUSP1P28562 367 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF91Q05481 1191 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF146Q15072 292 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 UTS2BQ765I0 119 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 TPRX1Q8N7U7 411 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 PYDC1Q8WXC3 89 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 RFKQ969G6 155 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 FGGYQ96C11 551 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 GNG8Q9UK08 70 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 TCF19Q9Y242 345 aa9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PPE2 198 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PR64 198 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PRV1 198 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM90A22PA8MWA6 464 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC16A6O15403 523 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 HAND1O96004 215 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 LMO1P25800 156 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP6V1E1P36543 226 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 OR3A1P47881 315 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 RBP2P50120 134 aa9.51□□□□□ -0.89
CLSTN3-211ENST00000541667 DYNLT3P51808 116 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms