RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 CDK2AP1O14519 115 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 CD3DP04234 171 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRB-204ENST00000538708 CCL8P80075 99 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRB-204ENST00000538708 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 H3F3AP84243 136 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 FCN2Q15485 313 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-204ENST00000538708 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.34□□□□□ -1.07
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