RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 NIT2Q9NQR4 276 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 GHRLQ9UBU3 117 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 A0A0B4J2A0 478 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SERPINA5P05154 406 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ZNF92Q03936 586 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 LINC00696Q6ZRV3 163 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OSGIN2Q9Y236 505 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 DSPP15924 2871 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PPE3 182 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CRHP06850 196 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FABP1P07148 127 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SP9P0CG40 484 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CPT2P23786 658 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ID4P47928 161 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 Q96M66 194 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CYTIPO60759 359 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SFT2D2O95562 160 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 KNG1P01042 644 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 IGKV1D-12P01611 117 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CD59P13987 128 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OPRM1P35372 400 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 RSU1Q15404 277 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SULF2Q8IWU5 870 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SVBPQ8N300 66 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OR2M7Q8NG81 312 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 GLYATL2Q8WU03 294 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CDC6Q99741 560 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 HRH4Q9H3N8 390 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OR2S2Q9NQN1 319 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 BIN3Q9NQY0 253 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 A0A096LPE4 126 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PPZ6 126 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FAM221AA4D161 298 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 H0YIZ8 118 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R31P59538 309 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ACTBL2Q562R1 376 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 RNF126Q9BV68 326 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 IL17BQ9UHF5 180 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SERPINE3A8MV23 424 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CCL2P13500 99 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 EDN3P14138 238 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FPR2P25090 351 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ITGA3P26006 1051 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PPT1P50897 306 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FAM3AP98173 230 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 FAM189A2Q15884 450 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PIGYQ3MUY2 71 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 METTL9Q9H1A3 318 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 PIGMQ9H3S5 423 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-213ENST00000492657 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CEACAM18A8MTB9 384 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 TXNL1O43396 289 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 NRASP01111 189 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C3AR1Q16581 482 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PIGCQ92535 297 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ISOC2Q96AB3 205 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 C10orf35Q96D05 121 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 PIK3IP1Q96FE7 263 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 OR10C1Q96KK4 312 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZPBPQ9BS86 351 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 LIME1Q9H400 295 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CALHM2Q9HA72 323 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 M0R296 226 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-213ENST00000492657 ZNF883P0CG24 379 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms