RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478365.1

DDX39B-218, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-218ENST00000478365 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 C4BPBP20851 252 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CCL1P22362 96 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 HLA-DMAP28067 261 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 IL2RGP31785 369 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SOX6P35712 828 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CAPGP40121 348 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CCR9P51686 369 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 AKR1D1P51857 326 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 HCCSP53701 268 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ISL1P61371 349 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GNB2P62879 340 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF91Q05481 1191 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PRDX4Q13162 271 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GRK1Q15835 563 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 NEDD8Q15843 81 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 AANATQ16613 207 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MICBQ29980 383 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CLLU1Q5K131 121 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LIPNQ5VXI9 398 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 FDX2Q6P4F2 183 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CATSPERDQ86XM0 798 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF573Q86YE8 665 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 OR51E1Q8TCB6 317 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PP6455Q8WZ26 134 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 HYLS1Q96M11 299 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TBX5Q99593 518 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SOX7Q9BT81 388 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MRI1Q9BV20 369 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 JAM3Q9BX67 310 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 COA4Q9NYJ1 87 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CLN8Q9UBY8 286 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GNG8Q9UK08 70 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 V9GYS6 101 aa6.66□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 C5orf63A6NC05 138 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SRRM5B3KS81 715 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 J3QRE1 110 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 WNT9BO14905 357 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SYT7O43581 403 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GABARAPO95166 117 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 NRASP01111 189 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LHBP01229 141 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 IGHA1P01876 353 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ISG15P05161 165 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GRPP07492 148 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 HTR1AP08908 422 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 WNT2P09544 360 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 GABRB1P18505 474 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ACKR3P25106 362 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PITPNBP48739 271 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 POU3F4P49335 361 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SPCS3P61009 180 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF154Q13106 437 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SPRNQ5BIV9 151 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF691Q5VV52 312 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TMEM42Q69YG0 159 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 COMMD7Q86VX2 200 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 NANPQ8TBE9 248 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CYGBQ8WWM9 190 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 PIGCQ92535 297 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LGALS12Q96DT0 336 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 LYZL4Q96KX0 146 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 OR51M1Q9H341 326 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MED9Q9NWA0 146 aa6.65□□□□□ -1.34
DDX39B-218ENST00000478365 MCUBQ9NWR8 336 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms