RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	NEDD8	Q15843	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DGUOK	Q16854	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CD276	Q5ZPR3	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	BIVM	Q86UB2	503 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TEX29	Q8N6K0	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		V9GY05	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	F8	P00451	2351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	RNF223	E7ERA6	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		J3QLI3	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359		K7N7A8	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SH2D1B	O14796	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SYNGR1	O43759	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CD5L	O43866	347 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF737	O75373	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CA11	O75493	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FOXH1	O75593	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TPPP	O94811	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NXPH2	O95156	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GABARAP	O95166	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IL1A	P01583	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SFTPB	P07988	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	HCK	P08631	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	INHBB	P09529	407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	AMY2B	P19961	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MYL9	P24844	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	HTR2C	P28335	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	PRDX2	P32119	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	IL13RA1	P78552	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	INSL4	Q14641	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CTF1	Q16619	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	S100A13	Q99584	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GFI1	Q99684	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	CST11	Q9H112	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NFX1-205	ENST00000466359	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms