RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462743.1

HPS1-206, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene HPS1, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-206ENST00000462743 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 NUP50Q9UKX7 468 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 KPTNQ9Y664 436 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 F8VVB4 439 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 F8VWA3 439 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MYL12BO14950 172 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 KDM4BO94953 1096 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CYB5AP00167 134 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CHRM2P08172 466 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RAB3AP20336 220 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 FPR2P25090 351 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 GABRA2P47869 451 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ZP1P60852 638 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 GMFBP60983 142 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 DOC2BQ14184 412 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ZNF146Q15072 292 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SPHARQ15513 63 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 KISS1Q15726 138 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 FGFRL1Q8N441 504 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 Q8NFD4 153 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 PXT1Q8NFP0 134 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ST8SIA4Q92187 359 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 TMEM106AQ96A25 262 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MND1Q9BWT6 205 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 K7N7A8 449 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RGS10O43665 173 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ZNF737O75373 536 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 PLATP00750 562 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 IGKV1D-12P01611 117 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 OCM2P0CE71 109 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SELLP14151 372 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CELP19835 753 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 EPHA1P21709 976 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 LMO1P25800 156 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 NPBWR2P48146 333 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SOX2P48431 317 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 FGF12P61328 243 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ELP2Q6IA86 826 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 RNF144BQ7Z419 303 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CDH26Q8IXH8 852 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SGCDQ92629 289 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 THRSPQ92748 146 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SLAMF9Q96A28 289 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 WDFY2Q96P53 400 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 OR5M11Q96RB7 305 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 SIRPDQ9H106 197 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 HMG20AQ9NP66 347 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 TMEM138Q9NPI0 162 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-206ENST00000462743 MAGEB3O15480 346 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 TK1P04183 234 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 FSTP19883 344 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 TGFBR2P37173 567 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 POU3F4P49335 361 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 ARF6P62330 175 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 IKZF1Q13422 519 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 TPBGQ13641 420 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 PDCD1Q15116 288 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 ARMCX4Q5H9R4 360 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 ZFP41Q8N8Y5 198 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 OR51A2Q8NGJ7 313 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 SNX22Q96L94 193 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 SPACA5Q96QH8 159 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 TBX15Q96SF7 602 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 TAS2R4Q9NYW5 299 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 BLOC1S6Q9UL45 172 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.96□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 M0R1W7 72 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 TCF21O43680 179 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 TOX4O94842 621 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 TFF1P04155 84 aa9.95□□□□□ -0.82
HPS1-206ENST00000462743 SFTPBP07988 381 aa9.95□□□□□ -0.82
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