RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STX19Q8N4C7 294 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF561Q8N587 486 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYDGFQ969H8 173 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEP19Q96LK0 163 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF488Q96MN9 340 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRI1Q9BV20 369 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NEK6Q9HC98 313 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SNTG1Q9NSN8 517 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCN3BQ9NY72 215 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DUX4Q9UBX2 424 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DHDHQ9UQ10 334 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KPTNQ9Y664 436 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 K7N7A8 449 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF737O75373 536 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KDM4BO94953 1096 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LMO1P25800 156 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KISS1Q15726 138 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q499Y3 187 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELP2Q6IA86 826 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC25A26Q70HW3 274 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RNF144BQ7Z419 303 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LYPD6Q86Y78 171 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDH26Q8IXH8 852 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PXT1Q8NFP0 134 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM106AQ96A25 262 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUP50Q9UKX7 468 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PTGES3LE9PB15 166 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SC5DO75845 299 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NXPH2O95156 264 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1D-12P01611 117 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD2P06729 351 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CHRM2P08172 466 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SELLP14151 372 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EPHA1P21709 976 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPBWR2P48146 333 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TPBGQ13641 420 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPHARQ15513 63 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FGFRL1Q8N441 504 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q8N7P7 452 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NPRL2Q8WTW4 380 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SGCDQ92629 289 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNFRSF14Q92956 283 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WDFY2Q96P53 400 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBX15Q96SF7 602 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MND1Q9BWT6 205 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMG20AQ9NP66 347 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYL12BO14950 172 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PIN1P1O15428 100 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TK1P04183 234 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OCM2P0CE71 109 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CELP19835 753 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FSTP19883 344 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RAB3AP20336 220 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HILS1P60008 231 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FGF12P61328 243 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPIN3Q5JUX0 258 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MS4A15Q8N5U1 240 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR51A2Q8NGJ7 313 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 THRSPQ92748 146 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MDFIQ99750 246 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM138Q9NPI0 162 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 M0R1W7 72 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RGS10O43665 173 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TCF21O43680 179 aa9.23□□□□□ -0.93
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYB5AP00167 134 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms