RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438265.5

RPE-211, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 3

Gene RPE, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-211ENST00000438265 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.86□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.86□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.86□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 NLKQ9UBE8 527 aa6.86□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 CKLFQ9UBR5 152 aa6.86□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.86□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.86□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 OR2AT4A6NND4 320 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ZNF879B4DU55 563 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 C3orf80F5H4A9 247 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 SIGLEC5O15389 551 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 AKR7A2O43488 359 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ADAM20O43506 726 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 RHBDL1O75783 438 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 SC5DO75845 299 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 NXPH2O95156 264 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 KNG1P01042 644 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 CD80P33681 288 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 RANBP1P43487 201 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 MTCP1P56278 107 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 CAV3P56539 151 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 IL13RA1P78552 427 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 TPBGQ13641 420 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 DOC2BQ14184 412 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 MED22Q15528 200 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 CALHM1Q8IU99 346 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ZNF561Q8N587 486 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 C3orf56Q8N813 242 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 PXT1Q8NFP0 134 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 SDSLQ96GA7 329 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 CEP19Q96LK0 163 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ZNF222Q9UK12 451 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 NOTCH1P46531 2555 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.85□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 MEGF11A6BM72 1044 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 KDM4BO94953 1096 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 HCKP08631 526 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 HKR1P10072 659 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 CPEP16870 476 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 GALP22466 123 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 KRTAP10-3P60369 221 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ZP1P60852 638 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 KISS1Q15726 138 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ELP2Q6IA86 826 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 Q8NFD4 153 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 DERL3Q96Q80 235 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 OR5M11Q96RB7 305 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 MGLLQ99685 303 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 IL36GQ9NZH8 169 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 CTSZQ9UBR2 303 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 GLS2Q9UI32 602 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 LRRC42Q9Y546 428 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.84□□□□□ -1.31
RPE-211ENST00000438265 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 A6NIN4 97 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 H3BSH0 61 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 TRIM77I1YAP6 450 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 DVL1O14640 695 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 NDUFB3O43676 98 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 SYNGR1O43759 233 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 ARL6IP5O75915 188 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 TNFAIP8O95379 198 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 GYPAP02724 150 aa6.83□□□□□ -1.32
RPE-211ENST00000438265 CHRM2P08172 466 aa6.83□□□□□ -1.32
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