RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.88■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 CHST1O43916 411 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 PIPP12273 146 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 LGALS4P56470 323 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 TCF23Q7RTU1 214 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 OR8H2Q8N162 312 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 CFHR4Q92496 578 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 RFKQ969G6 155 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 CDCA4Q9BXL8 241 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 SIGLEC9Q9Y336 463 aa16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 DSCAML1Q8TD84 2053 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF728P0DKX0 622 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 KIR3DL2P43630 455 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF85Q03923 595 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF626Q68DY1 528 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 Q6ZTK2 550 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 SLC25A26Q70HW3 274 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 DTX3Q8N9I9 347 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 DNAAF1Q8NEP3 725 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 OR2T6Q8NHC8 308 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 PP6455Q8WZ26 134 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 SLAMF9Q96A28 289 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 RIBC2Q9H4K1 309 aa16.86■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 SERPINA3P01011 423 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 CSF1P09603 554 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 GDPD3Q7L5L3 318 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 Q8IYB0 196 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 BORCS8Q96FH0 119 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 SNX22Q96L94 193 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 ADI1Q9BV57 179 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 TCF19Q9Y242 345 aa16.85■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM82A0PJX8 343 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 H3BSH0 61 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 IGHV1-8P0DP01 117 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 ATP6V1E1P36543 226 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 EDDM3BP56851 147 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 CDC42P60953 191 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 Q8N2B8 174 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 KLHDC1Q8N7A1 406 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 MALSU1Q96EH3 234 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF714Q96N38 554 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 GNG8Q9UK08 70 aa16.84■□□□□ 0.29
UBXN4-204ENST00000426921 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 J3QRE1 110 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ARG1P05089 322 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 RBP2P50120 134 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 DYNLT3P51808 116 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF91Q05481 1191 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF146Q15072 292 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 TP53I3Q53FA7 332 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 SLC25A30Q5SVS4 291 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 FDX2Q6P4F2 183 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 UTS2BQ765I0 119 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 OR2G2Q8NGZ5 317 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 IL36RNQ9UBH0 155 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 FOXJ3Q9UPW0 622 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 LINC00312Q9Y6C7 94 aa16.83■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 hADV38S2A0JD32 116 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 E9PQ18 207 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 HAND1O96004 215 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ISG15P05161 165 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ALPLP05186 524 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ACTC1P68032 377 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ACTA1P68133 377 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM244Q5VVB8 128 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 RDH10Q8IZV5 341 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 MBOAT4Q96T53 435 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF702PQ9H963 129 aa16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 A6NDX4 124 aa16.81■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 IGHA1P01876 353 aa16.81■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 ATP1B3P54709 279 aa16.81■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 SPIN3Q5JUX0 258 aa16.81■□□□□ 0.28
UBXN4-204ENST00000426921 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms