RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CACNA1CQ13936 2221 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HMSDA8MTL9 139 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 AHRRA9YTQ3 701 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 IL2RAP01589 272 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3-9P01782 118 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TPOP07202 933 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CD79AP11912 226 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SERPINA2P20848 420 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 AGAP20933 346 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 DTYMKP23919 212 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HRH1P35367 487 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 APLNRP35414 380 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CA7P43166 264 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR3A3P47888 321 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TDGF1P3P51864 188 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TESK1Q15569 626 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR2A2Q6IF42 318 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 LIN54Q6MZP7 749 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MOB3CQ70IA8 216 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RNF144BQ7Z419 303 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR4S1Q8NGB4 309 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 WNT2BQ93097 391 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FBXW5Q969U6 566 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.65□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 A0A096LPE4 126 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0B4J2A0 478 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PPZ6 126 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C5orf49A4QMS7 147 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 F5H5P2 479 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SMLR1H3BR10 107 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SLC22A5O76082 557 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 HTR3BO95264 441 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 HLA-HP01893 362 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 AMY2BP19961 511 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TUBG1P23258 451 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FGL1Q08830 312 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 IKZF1Q13422 519 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 Q5BKY6 102 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ELP2Q6IA86 826 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 LYG2Q86SG7 212 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CD163Q86VB7 1156 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OSR2Q8N2R0 312 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PIGCQ92535 297 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 C14orf79Q96F83 325 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PHB2Q99623 299 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 RHOFQ9HBH0 211 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PP11 408 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PLSCR5A0PG75 271 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 RAD51DO75771 328 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CLDN14O95500 239 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 IL18BPO95998 194 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 PMP2P02689 132 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 ZBTB25P24278 435 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 FPR2P25090 351 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 CD34P28906 385 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
POLR1A-204ENST00000424089 TSPAN5P62079 268 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms