RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2K2Q8NGT1 345 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR5K2Q8NHB8 316 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 LHFPL5Q8TAF8 219 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NDNFQ8TB73 568 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 HIST1H2BAQ96A08 127 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 SRRQ9GZT4 340 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 RMND5AQ9H871 391 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PISDQ9UG56 409 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 STARD10Q9Y365 291 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 HEY1Q9Y5J3 304 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ABCC9O60706 1549 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CACNA1SQ13698 1873 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 LECT2O14960 151 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2A4O95047 310 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAP1GDS1P52306 607 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 BST2Q10589 180 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM241Q24JQ0 296 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NIT1Q86X76 327 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF619Q8N2I2 560 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ERMNQ8TAM6 284 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIFAP3Q92845 792 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 RPEQ96AT9 228 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 APH1AQ96BI3 265 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM19A4Q96LR4 140 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 GLT1D1Q96MS3 346 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2A7Q96R45 310 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NIT2Q9NQR4 276 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 STK38LQ9Y2H1 464 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PPIL1Q9Y3C6 166 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 USH1CQ9Y6N9 552 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 AK9Q5TCS8 1911 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 GOLGA8JA6NMD2 632 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 SIRPB1O00241 398 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 GOLGA8HP0CJ92 632 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PSMA5P28066 241 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP6V1E1P36543 226 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 RWDD2BP57060 319 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PSG3Q16557 428 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CTSL3PQ5NE16 218 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAPSLQ8WWF8 208 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 RXFP2Q8WXD0 754 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CEP170Q5SW79 1584 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ALPK2Q86TB3 2170 aa-0.97□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 GRIFINA4D1Z8 144 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMCO2A6NFE2 343 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2B6P58173 313 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC183Q5T5S1 534 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 GRINAQ7Z429 371 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 DPPA2Q7Z7J5 298 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 BBS5Q8N3I7 341 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR9K2Q8NGE7 335 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSGA10Q9BZW7 698 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARV1Q9H2C2 271 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 TAS2R3Q9NYW6 316 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC22A20A6NK97 555 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 NDUFAB1O14561 156 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAGEB3O15480 346 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLOCKO15516 846 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC37A4O43826 429 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 HBE1P02100 147 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAB5AP20339 215 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 PSMB2P49721 201 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2B8PP59922 312 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 HTR4Q13639 388 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2T5Q6IEZ7 315 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAB43Q86YS6 212 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q8N6K4 173 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF283Q8N7M2 679 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2T29Q8NH02 315 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADTRPQ96IZ2 230 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR21Q99679 349 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 CALN1Q9BXU9 219 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARL6Q9H0F7 186 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 C8orf4Q9NR00 106 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 CLN6Q9NWW5 311 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU2-38P-201ENST00000410856 SNX6Q9UNH7 406 aa-0.99□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms