RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 OR2B8PP59922 312 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 MOGAT3Q86VF5 341 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 F2RL2O00254 374 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 DNPH1O43598 174 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 TMEM171Q8WVE6 324 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 DPF1Q92782 380 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 CADM3Q8N126 398 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 OR2H1Q9GZK4 316 aa22.16■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 SP6Q3SY56 376 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 OR4F17Q8NGA8 305 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 IGHA2P01877 340 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 PGA3P0DJD8 388 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 ADTRPQ96IZ2 230 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 CNTD2Q9H8S5 307 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF721Q8TF20 911 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 S100A4P26447 101 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 PRR27Q6MZM9 219 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 MCM3APO60318 1980 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 A0A1W2PRD5 423 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 A0A1W2PRF3 423 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 A0A1W2PRM7 423 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 DBX1A6NMT0 343 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 GFRA3O60609 400 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 CD80P33681 288 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 FBXW9Q5XUX1 488 aa22.15■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 C10orf35Q96D05 121 aa22.14■■□□□ 1.14
SPIRE1-202ENST00000409402 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 KRTCAP3Q53RY4 240 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 COL4A5P29400 1685 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 C17orf47Q8NEP4 570 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 OR51I2Q9H344 312 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 UQCC1Q9NVA1 299 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 EPOPA6NHQ4 379 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 SEC14L6B5MCN3 397 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 CST7O76096 145 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 ACSM4P0C7M7 580 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 HIKESHIQ53FT3 197 aa22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 CD37P11049 281 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 BAK1Q16611 211 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 SMIM7Q9BQ49 75 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 MASP2O00187 686 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 CA10Q9NS85 328 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 DCTN6O00399 190 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 CTAG2O75638 210 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 OR2C1O95371 312 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 CES1P1Q9UKY3 287 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 UCN2Q96RP3 112 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 TREM2Q9NZC2 230 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa22.13■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 PLXNB2O15031 1838 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 RXFP4Q8TDU9 374 aa22.12■■□□□ 1.13
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SPIRE1-202ENST00000409402 GLCCI1Q86VQ1 547 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 OR8D4Q8NGM9 314 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 OR13D1Q8NGV5 346 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 PIK3IP1Q96FE7 263 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 TINAGQ9UJW2 476 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 GDF15Q99988 308 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 HAND1O96004 215 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 PDGFAP04085 211 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 CD96P40200 585 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 C14orf79Q96F83 325 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF665Q9H7R5 613 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 TMEM38BQ9NVV0 291 aa22.12■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 PPP1R2P9O14990 202 aa22.11■■□□□ 1.13
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SPIRE1-202ENST00000409402 ZNRF4Q8WWF5 429 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 RAB40CQ96S21 281 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 OOEPA6NGQ2 149 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 COL19A1Q14993 1142 aa22.11■■□□□ 1.13
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SPIRE1-202ENST00000409402 VSTM2AQ8TAG5 236 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 K7ESF4 209 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 ANKRD34CP0C6C1 535 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 PRSS12P56730 875 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 PLAC9Q5JTB6 97 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 NECAP1Q8NC96 275 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 FAM157AC9JC47 383 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC31A2O15432 143 aa22.11■■□□□ 1.13
SPIRE1-202ENST00000409402 ID4P47928 161 aa22.11■■□□□ 1.13
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