RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TAPBPLQ9BX59 468 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TM6SF2Q9BZW4 377 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CHST5Q9GZS9 411 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NT5MQ9NPB1 228 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PXMP2Q9NR77 195 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NINJ2Q9NZG7 142 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ENPP4Q9Y6X5 453 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 JCADQ9P266 1359 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UBN2Q6ZU65 1347 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IGSF23A1L1A6 192 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR52A4PA6NMU1 304 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CLDN11O75508 207 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPSAP08865 295 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HLA-GP17693 338 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HLA-DPA1P20036 260 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ATP6V1C1P21283 382 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FOXN2P32314 431 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RAB11AP62491 216 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ERHP84090 104 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF117Q03924 483 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF90Q03938 601 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KDSRQ06136 332 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SCGB2A2Q13296 93 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TGFBIQ15582 683 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM241Q24JQ0 296 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF404Q494X3 552 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM155Q4W5P6 130 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ISLR2Q6UXK2 745 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NIPA1Q7RTP0 329 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRNTQ86SH4 94 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TBC1D21Q8IYX1 336 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC35F6Q8N357 371 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BBS5Q8N3I7 341 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR1L4Q8NGR5 311 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LHFPL5Q8TAF8 219 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TCP10LQ8TDR4 215 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCDC126Q96EE4 140 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ADTRPQ96IZ2 230 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SENP8Q96LD8 212 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM111AQ96PZ2 611 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRRT1Q99946 306 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UQCC2Q9BRT2 126 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC39A3Q9BRY0 314 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMEM70Q9BUB7 260 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF426Q9BUY5 554 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TSSK6Q9BXA6 273 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 POTEKPQ9BYX7 375 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARL6Q9H0F7 186 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C8orf4Q9NR00 106 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HRASLS2Q9NWW9 162 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BTRCQ9Y297 605 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 U3KQV3 271 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DOCK3Q8IZD9 2030 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MEIKINA0A087WXM9 373 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UPK2O00526 184 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC25A20O43772 301 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC16A7O60669 478 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SOX14O95416 240 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPR75O95800 540 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SOD1P00441 154 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IL1BP01584 269 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MT-ND3P03897 115 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GABRA1P14867 456 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CAMLGP49069 296 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FABP6P51161 128 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR1Q1Q15612 314 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PDK4Q16654 411 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPINK9Q5DT21 86 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 STEAP4Q687X5 459 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GLYATQ6IB77 296 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SDIM1Q6ZPB5 146 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM231DQ6ZW35 169 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LINC00337Q8N6G1 96 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR11G2Q8NGC1 345 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 APH1AQ96BI3 265 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CPB2Q96IY4 423 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM19A4Q96LR4 140 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MBOAT7Q96N66 472 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms