RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.73□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 SSSCA1O60232 199 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 NPIPB7O75200 414 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 CLDN1O95832 211 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 SSX9Q7RTT3 188 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 PLA1AQ53H76 456 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM104Q8NE00 496 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 ACTL6BO94805 426 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 MICBQ29980 383 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 LYPD8Q6UX82 237 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 Q8IYB0 196 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 SOX7Q9BT81 388 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF724A8MTY0 619 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 NEURL1O76050 574 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 CXCL3P19876 107 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 RAB39BQ96DA2 213 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 DLL4Q9NR61 685 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 OR5B21A6NL26 309 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 C3orf80F5H4A9 247 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 SSX5O60225 188 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 GPR137BO60478 399 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 WISP1O95388 367 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF708P17019 499 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 CEACAM6P40199 344 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 GPR12P47775 334 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 FDX2Q6P4F2 183 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.72□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 NGFP01138 241 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 PSMB6P28072 239 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 GZMKP49863 264 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 GALMQ96C23 342 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 MSL2Q9HCI7 577 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 A0A0G2JK05 382 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 LRP5LA4QPB2 252 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 LHX2P50458 406 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 SDSLQ96GA7 329 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.71□□□□□ -1.01
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 RGS11O94810 467 aa8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 ADAM10O14672 748 aa8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 HPXP02790 462 aa8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 SLC51BQ86UW2 128 aa8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.71□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 TOR1AO14656 332 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 SFT2D2O95562 160 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 CLDN18P56856 261 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 UBE2V2Q15819 145 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 C2orf50Q96LR7 162 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 RND1Q92730 232 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 B8ZZF3 427 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 F8W036 122 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 MPPED1O15442 326 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 AADACP22760 399 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 BLOC1S1P78537 153 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 VSIG4Q9Y279 399 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 ICMTO60725 284 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 TNFSF10P50591 281 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF524Q96C55 264 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 IAPPP10997 89 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 UCP2P55851 309 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 TMPRSS3P57727 454 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 FHL1Q13642 323 aa8.7□□□□□ -1.02
TTPAL-202ENST00000372904 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms