RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 SLC6A7Q99884 636 aa13.07□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa13.07□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 RTL8AQ9BWD3 113 aa13.07□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 C20orf85Q9H1P6 137 aa13.07□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0A6YYJ9 748 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2QL1A1L167 161 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 DPRXA6NFQ7 191 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 F5H5P2 479 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CDIPTO14735 213 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PMP2P02689 132 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CD74P04233 296 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ROS1P08922 2347 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CHATP28329 748 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 RCVRNP35243 200 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GMFBP60983 142 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 BTG1P62324 171 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MAB21L1Q13394 359 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ELP2Q6IA86 826 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM200AQ86VY9 491 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 BEST4Q8NFU0 473 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 OCSTAMPQ9BR26 566 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 COPZ2Q9P299 210 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 AK3Q9UIJ7 227 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NKX2-6A6NCS4 301 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 A8MV72 311 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ERVH48-1M5A8F1 160 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 AKR7A2O43488 359 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 AMY2AP04746 511 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PRKACAP17612 351 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TUBG1P23258 451 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 HRH1P35367 487 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GLRXP35754 106 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ADORA2A-AS1P86434 159 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 IL24Q13007 206 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF154Q13106 437 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ATAD3CQ5T2N8 411 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF826PQ6ZT77 177 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 BPIFB2Q8N4F0 458 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SYT3Q9BQG1 590 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa13.06□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 FAM221AA4D161 298 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFB6O95139 128 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MPZP25189 248 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 FAUP35544 74 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 FGF12P61328 243 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf53Q8IXP5 236 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CHAC2Q8WUX2 184 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM171Q8WVE6 324 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GINS4Q9BRT9 223 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 HSF4Q9ULV5 492 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SPEF1Q9Y4P9 236 aa13.05□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 LRP5LA4QPB2 252 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 DHFRP00374 187 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF250P15622 560 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NAT1P18440 290 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GRNP28799 593 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MPPED2Q15777 294 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MICBQ29980 383 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 OR4K15Q8NH41 348 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 PKIBQ9C010 78 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ANAPC10Q9UM13 185 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 HMX3A6NHT5 357 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SERPINE3A8MV23 424 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 J3QT63 122 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 SPRNQ5BIV9 151 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 IDO2Q6ZQW0 420 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 HOGA1Q86XE5 327 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf174Q8IYL3 243 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 FAM58AQ8N1B3 248 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 DEDD2Q8WXF8 326 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CHST6Q9GZX3 395 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GHITMQ9H3K2 345 aa13.04□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ABCD4O14678 606 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV3-13P01766 116 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 HPXP02790 462 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 FUT3P21217 361 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 BSPH1Q075Z2 132 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 CBX3Q13185 183 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 ST3GAL2Q16842 350 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 AKAP14Q86UN6 197 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 OR2Z1Q8NG97 314 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 OR13G1Q8NGZ3 307 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 GIMAP1Q8WWP7 306 aa13.03□□□□□ -0.32
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms