RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SCN2AQ99250 2005 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CDK2AP1O14519 115 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FGF16O43320 207 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR5AC1P0C628 307 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CD46P15529 392 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ALDH3B1P43353 468 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CLINT1Q14677 625 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 Q96M66 194 aa7.75□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 HKR1P10072 659 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 STK11Q15831 433 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ROBO4Q8WZ75 1007 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SLAMF9Q96A28 289 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 HSD17B6O14756 317 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SERPINA7P05543 415 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CCL3P10147 92 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 UCP3P55916 312 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 BAXQ07812 192 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CATR1Q13166 79 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MIDNQ504T8 468 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR5B12Q96R08 314 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SPSB2Q99619 263 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CALHM2Q9HA72 323 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 LRFN1Q9P244 771 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 C17orf51A8MQB3 221 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MMP9P14780 707 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PCOLCEQ15113 449 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 STPG1Q5TH74 334 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SGK3Q96BR1 496 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TAAR9Q96RI9 348 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 DEGS1O15121 323 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MT-ND4LP03901 98 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FCGR3AP08637 254 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 QRFPP83859 136 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR10D3Q8NH80 312 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SLC35B3Q9H1N7 401 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.74□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GV50 99 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PMELP40967 661 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 Q8IYB0 196 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 GPR35Q9HC97 309 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 B4E171 279 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TRDCB7Z8K6 153 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 G3V3Q6 166 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN7P41732 249 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MPV17LQ2QL34 196 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 GLRX5Q86SX6 157 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 MPPED1O15442 326 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 OR2C3Q8N628 320 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 WDSUB1Q8N9V3 476 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 IL36GQ9NZH8 169 aa7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
HERC3-201ENST00000264345 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.73□□□□□ -1.17
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