RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 ERHP84090 104 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 C1QL3Q5VWW1 255 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 CADM3Q8N126 398 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 MEIKINA0A087WXM9 373 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 APOC3P02656 99 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 MPGP29372 298 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM54Q969K7 222 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ANGPTL7O43827 346 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 NME2P1O60361 137 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 NME2P22392 152 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 MEOX1P50221 254 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 TESK1Q15569 626 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 MPV17LQ2QL34 196 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SIAH3Q8IW03 269 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 GPX8Q8TED1 209 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 WNT2BQ93097 391 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SCMH1Q96GD3 660 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM82A0PJX8 343 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 TNFRSF10AO00220 468 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SFTPCP11686 197 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 MPZP25189 248 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 H3F3AP84243 136 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 RTP5Q14D33 572 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ASB5Q8WWX0 329 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 KIRREL1Q96J84 757 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 MAP6Q96JE9 813 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ARV1Q9H2C2 271 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 DTYMKP23919 212 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 WDR1O75083 606 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PEA15Q15121 130 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 EMC6Q9BV81 110 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 CTSBP07858 339 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF79Q15937 498 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 COMMD7Q86VX2 200 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 KDM8Q8N371 416 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 IL36GQ9NZH8 169 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 HSF4Q9ULV5 492 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 GNG10P50151 68 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 RHOBP62745 196 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 FHL1Q13642 323 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 BEX5Q5H9J7 111 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 DYNLRB2Q8TF09 96 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 A0A0D9SG52 128 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1W2PRD5 423 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1W2PRF3 423 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1W2PRM7 423 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF708P17019 499 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 OR51H1Q8NH63 302 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 REEP6Q96HR9 211 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 GPR35Q9HC97 309 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 TIAF1O95411 115 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 RBP4P02753 201 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 OR10A3P58181 314 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 IL13RA2Q14627 380 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPN3-201ENST00000262539 SKA3Q8IX90 412 aa7.23□□□□□ -1.25
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