RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 ZNF529Q6P280 563 aa16.09■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 AQP10Q96PS8 301 aa16.09■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 NRIP2Q9BQI9 281 aa16.09■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 FANCFQ9NPI8 374 aa16.09■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 BIN3Q9NQY0 253 aa16.09■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 C10orf142B7Z368 130 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 C9JQL5 133 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 CD37P11049 281 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 ZNF708P17019 499 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 RAC1P63000 192 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 OR11L1Q8NGX0 322 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 KIRREL1Q96J84 757 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 MAGT1Q9H0U3 335 aa16.08■□□□□ 0.17
LRP3-201ENST00000253193 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 TCN2P20062 427 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 MEOX2P50222 304 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 F2RL1P55085 397 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 MIDNQ504T8 468 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 TMEM217Q8N7C4 229 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 GLYATL2Q8WU03 294 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 FOXB1Q99853 325 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SRXN1Q9BYN0 137 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 WNT16Q9UBV4 365 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 C1QL1O75973 258 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 FAM157CP0CG43 387 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 CD79AP11912 226 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 OR8U1Q8NH10 309 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SPSB1Q96BD6 273 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 LUZP4Q9P127 313 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 EDARQ9UNE0 448 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 AMDHD2Q9Y303 409 aa16.08■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 F8VVB4 439 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 F8VWA3 439 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 OR13C7P0DN81 318 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 RAB5BP61020 215 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 TMEM268Q5VZI3 342 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SEMA5BQ9P283 1151 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ST8SIA3O43173 380 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 TNFSF12O43508 249 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ECI1P42126 302 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 GPHA2Q96T91 129 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SPACA1Q9HBV2 294 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 NUDT19A8MXV4 375 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 DAOP14920 347 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 RAB35Q15286 201 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 LGI3Q8N145 548 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SFT2D1Q8WV19 159 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SEC11CQ9BY50 192 aa16.07■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 E5RGE8 158 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 EPHA1P21709 976 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 PRR18Q8N4B5 295 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SAP25Q8TEE9 199 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 CALHM2Q9HA72 323 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 NSG2Q9Y328 171 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 DOCK7Q96N67 2140 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ZIC3O60481 467 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 FHITP49789 147 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ERGIC1Q969X5 290 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 NAA60Q9H7X0 242 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 NAT2P11245 290 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 CCL1P22362 96 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 FADS6Q8N9I5 356 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SLC2A9Q9NRM0 540 aa16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 FAM27BQ5VT28 67 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 LHFPL1Q86WI0 220 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 OR10D3Q8NH80 312 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ABHD3Q8WU67 409 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 ISOC2Q96AB3 205 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 Q96M66 194 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 CLDN15P56746 228 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 KCNMB1Q16558 191 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 SMCO4Q9NRQ5 59 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LRP3-201ENST00000253193 LINC00587B1AMM8 73 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms