RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 ST3GAL6Q9Y274 331 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 NCOR1O75376 2440 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 APOC1P02654 83 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 CCNOP22674 350 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 CHATP28329 748 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM33P57088 247 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 PJVKQ0ZLH3 352 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 Q6ZSR3 168 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 C9JQL5 133 aa22.14■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 AKIRIN2Q53H80 203 aa22.14■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.14■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa22.14■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 CALHM1Q8IU99 346 aa22.14■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 SPSB1Q96BD6 273 aa22.14■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF407Q9C0G0 2248 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 LRRC3CA6NJW4 275 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 PET100P0DJ07 73 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 NPBWR2P48146 333 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 FAM3AP98173 230 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 SRYQ05066 204 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 MEMO1Q9Y316 297 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 DNAJC13O75165 2243 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF728P0DKX0 622 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 TCN2P20062 427 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 NTNG2Q96CW9 530 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 GPHA2Q96T91 129 aa22.14■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 ASPMQ8IZT6 3477 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 PLCXD3Q63HM9 321 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 SPINK14Q6IE38 97 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 OR2H1Q9GZK4 316 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 DNAJB11Q9UBS4 358 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 LOC400499M0QZD8 3231 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 OR6C6A6NF89 314 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 C3orf80F5H4A9 247 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 DEDDO75618 318 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 CST2P09228 141 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 SRD5A2P31213 254 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 ABCA11PQ4W5N1 156 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 PRRX2Q99811 253 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 AMDHD2Q9Y303 409 aa22.13■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 KNTC1P50748 2209 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 RRP8O43159 456 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 MBPP02686 304 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 GDF1P27539 372 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 OSR2Q8N2R0 312 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 NECAP2Q9NVZ3 263 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 CRIM1Q9NZV1 1036 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 A0A096LPE4 126 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 A0A1W2PPZ6 126 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 IFNA21P01568 189 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 EDN3P14138 238 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 ASCL1P50553 236 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 C10orf35Q96D05 121 aa22.12■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 GJE1A6NN92 205 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 CD80P33681 288 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 ARL6IP1Q15041 203 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 ETV3LQ6ZN32 361 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 OR52M1Q8NGK5 317 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 SMIM8Q96KF7 97 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 TCEAL3Q969E4 200 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 HS3ST6Q96QI5 342 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 NRIP2Q9BQI9 281 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 CYC1P08574 325 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 OR8U9P0C7N5 309 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 PDZK1IP1Q13113 114 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 OR5T2Q8NGG2 359 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 OR8U1Q8NH10 309 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 OR2V1Q8NHB1 315 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 CPT1CQ8TCG5 803 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 SGCZQ96LD1 299 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 AKR1C3P42330 323 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 FHITP49789 147 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM187Q14656 261 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 SMCO1Q147U7 214 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 IGSF11Q5DX21 431 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 ACER2Q5QJU3 275 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 Q6ZRG5 221 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 GPR35Q9HC97 309 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 SLC2A9Q9NRM0 540 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 TCFL5Q9UL49 500 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 CA11O75493 328 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 CELA3AP09093 270 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms