RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 TMEM268Q5VZI3 342 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 NPRL2Q8WTW4 380 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 IL36GQ9NZH8 169 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 LRRC3CA6NJW4 275 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 DEDDO75618 318 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 HEXAP06865 529 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 HOXB5P09067 269 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 RAC3P60763 192 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 OR51F2Q8NH61 342 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 KCNE4Q8WWG9 221 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 PIGTQ969N2 578 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 FBXO17Q96EF6 278 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 GALNT14Q96FL9 552 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 RGCCQ9H4X1 137 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 TAF9BQ9HBM6 251 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 PARP11Q9NR21 331 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 NECAP2Q9NVZ3 263 aa22.81■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 SYNGR3O43761 229 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 TMEM225BP0DP42 221 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 PMELP40967 661 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 MTCP1P56278 107 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 TMEM42Q69YG0 159 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 C6orf201Q7Z4U5 140 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 LRRC18Q8N456 261 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 LRTM2Q8N967 370 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 BHLHE23Q8NDY6 225 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa22.8■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 A0A0J9YW62 118 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 SIGLEC5O15389 551 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 SGCEO43556 437 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 SPINK2P20155 84 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 CD82P27701 267 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 GUCA2BQ16661 112 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 HFEQ30201 348 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 DCAF10Q5QP82 559 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 CPT1CQ8TCG5 803 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 UCN2Q96RP3 112 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 MICU1Q9BPX6 476 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 TREM1Q9NP99 234 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 DEPPQ9NTK1 212 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 PRR13Q9NZ81 148 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 GSKIPQ9P0R6 139 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 IL17BQ9UHF5 180 aa22.79■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 K7EPK0 472 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 KNG1P01042 644 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 SFTPBP07988 381 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 RPL12P30050 165 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 S100A10P60903 97 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 FAM3AP98173 230 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 TMEM200AQ86VY9 491 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 DTX1Q86Y01 620 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 OR1F12Q8NHA8 337 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 NRIP2Q9BQI9 281 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 SUCNR1Q9BXA5 334 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 RHOFQ9HBH0 211 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 CACNA1AO00555 2505 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 OR5H8P0DN80 308 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 ARHGDIBP52566 201 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 RSU1Q15404 277 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 SNAI3Q3KNW1 292 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 BTNL8Q6UX41 500 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 MAFIPQ8WZ33 124 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 TECTBQ96PL2 329 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 ARV1Q9H2C2 271 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 GPR173Q9NS66 373 aa22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 NCKAP5O14513 1909 aa22.77■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 GABRR1P24046 479 aa22.77■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 CHATP28329 748 aa22.77■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 UCP3P55916 312 aa22.77■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 GGNBP1Q5YKI7 109 aa22.77■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 LYPD6BQ8NI32 183 aa22.77■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 REEP6Q96HR9 211 aa22.77■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 SCNM1Q9BWG6 230 aa22.77■■□□□ 1.24
TPI1-201ENST00000229270 ASPMQ8IZT6 3477 aa22.77■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 OR6C6A6NF89 314 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 DBHP09172 617 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 ABHD17BQ5VST6 288 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 COMMD1Q8N668 190 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 TLNRD1Q9H1K6 362 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 BCO1Q9HAY6 547 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 OR2S2Q9NQN1 319 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 TMEM38BQ9NVV0 291 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 LRFN1Q9P244 771 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa22.76■■□□□ 1.23
TPI1-201ENST00000229270 CD5P06127 495 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108 ms