RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PSMB6P28072 239 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 GLP1RP43220 463 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 TNFSF10P50591 281 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ST8SIA2Q92186 375 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PRSS50Q9UI38 385 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 RNF222A6NCQ9 220 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A10PA6NDY2 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 LRP3O75074 770 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CST4P01036 141 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FUT3P21217 361 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 GLRA1P23415 457 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CALCRP30988 508 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 OPRM1P35372 400 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 HAAOP46952 286 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 NUBP1P53384 320 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 AANATQ16613 207 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SLC22A25Q6T423 547 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CALHM1Q8IU99 346 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CACNA1HO95180 2353 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 POM121CA8CG34 1229 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 NMBP08949 121 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PMELP40967 661 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CCL11P51671 97 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 GPM6AP51674 278 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 MKXQ8IYA7 352 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 DYRK2Q92630 601 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 TOMM40LQ969M1 308 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 GLRX2Q9NS18 164 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 MED9Q9NWA0 146 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CD300LBA8K4G0 201 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF732B4DXR9 585 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PRSS44E7EML9 344 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 NKX2-8O15522 239 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ADAP1O75689 374 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 IL18BPO95998 194 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 IFNA21P01568 189 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PDGFAP04085 211 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 RLN2P04090 185 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF728P0DKX0 622 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 BCL3P20749 454 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PTGER4P35408 488 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FXYD4P59646 89 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FGF12P61328 243 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 HERV-K104P61576 105 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PMP22Q01453 160 aa7.12□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 TGFBR3Q03167 851 aa7.12□□□□□ -1.27
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