RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phox2aQ62066 280 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Flrt1Q6RKD8 674 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CblcQ80XL1 496 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Negr1Q80Z24 348 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam53bQ8BGR5 422 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prss50Q8BLH5 439 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc35e1Q8CD26 409 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl48Q8JZS9 211 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syngr3Q8R191 229 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl6ip5Q8R5J9 188 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem144Q8VEH0 348 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ackr4Q924I3 350 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bhlhe41Q99PV5 410 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NubplQ9CWD8 319 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TsfmQ9CZR8 324 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl5bQ9D4P0 179 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpep3Q9DA79 493 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Erv3Q9DAX3 200 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufa9Q9DC69 377 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Riox1Q9JJF3 603 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1158A2BHP7 313 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4181E9Q7X3 184 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5798F7BTS7 198 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10881P01642 115 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NppaP05125 152 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gabrg2P22723 474 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fcgr1P26151 404 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CapzbP47757 277 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RpiaP47968 303 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spatc1Q148B6 480 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc38a11Q3USY0 453 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Timm8a2Q4FZG7 97 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zdhhc8Q5Y5T5 762 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr61Q8C010 449 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Crtac1Q8R555 646 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1086Q8VFL9 310 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1008Q8VGC7 313 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr283Q8VGU2 309 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc22a26Q91WJ2 552 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Emc6Q9CQW0 110 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9CWB7 115 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rep15Q9D7T1 230 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dazap2Q9DCP9 168 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr943Q9EQ92 314 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fzd5Q9EQD0 585 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aqp9Q9JJJ3 295 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lancl2Q9JJK2 450 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SnapinQ9Z266 136 aa5.87□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ralgapa1Q6GYP7 2035 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtprbB2RU80 1998 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21488A0A087WR99 222 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 A0A286YDG0 184 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FggyA2AJL3 552 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10376D3YXI8 184 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10375L7N286 184 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bet1O35623 118 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GamtO35969 236 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Avpr2O88721 371 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il4P07750 140 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igf2P09535 180 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsd17b8P50171 259 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klf16P58334 251 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CycsP62897 105 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pon3Q62087 354 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nol4lQ6DIB4 494 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp747Q8BHM7 422 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BTC1 67 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clec2hQ8C1T8 218 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Commd1Q8K4M5 188 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr922Q8VG50 311 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr522Q8VGL1 312 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbm39Q8VH51 530 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cela1Q91X79 266 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hyal1Q91ZJ9 462 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cep41Q99NF3 373 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rtn4rQ99PI8 473 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtfp1Q9CRB8 166 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp23Q9CWQ3 201 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 9230110F15RikQ9D262 117 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 S100a16Q9D708 124 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sec11cQ9D8V7 192 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700001F09RikQ9DAR5 184 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gal3st1Q9JHE4 423 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nat8Q9JIY7 227 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssna1Q9JJ94 119 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc30a7Q9JKN1 378 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm12117V9GXK0 151 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trip12G5E870 2025 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AgrnA2ASQ1 1950 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr199F6ZUS0 308 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspan15F7BWT7 294 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21818J3KMS6 170 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FaimlJ3QPY3 178 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AF067061O70616 171 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AhsgP29699 345 aa5.86□□□□□ -1.47
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Id4P41139 161 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.8 ms