RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	EFNA3	P52797	238 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	TAS2R30	P59541	319 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	HSPB2	Q16082	182 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624		Q6ZSR6	202 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	OBP2A	Q9NY56	170 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	PTPRS	Q13332	1948 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	PRSS38	A1L453	326 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	RAMP1	O60894	148 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	NGFR	P08138	427 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	AGA	P20933	346 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	CHRNA7	P36544	502 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	OR3A4P	P47883	348 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	FAM3A	P98173	230 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	MEST	Q5EB52	335 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	ANGPTL7	O43827	346 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	HKR1	P10072	659 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	PMP22	Q01453	160 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	HHEX	Q03014	270 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	DPT	Q07507	201 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	CLN3	Q13286	438 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	GFI1	Q99684	422 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624		A0A0J9YY10	115 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624		A0A1W2PR80	420 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624		H0YIZ8	118 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	SEMA4F	O95754	770 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	TNF	P01375	233 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	ATP6V0C	P27449	155 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	GNG10	P50151	68 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	MMP16	P51512	607 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	HIST1H3A	P68431	136 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	HBG1	P69891	147 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	HBG2	P69892	147 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	GABRE	P78334	506 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	GCM1	Q9NP62	436 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	PTPRD	P23468	1912 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PXN-222	ENST00000637624	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624		A0A1W2PP11	408 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	CLDN1	O95832	211 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	ADH1B	P00325	375 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	FCAR	P24071	287 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	IL2RG	P31785	369 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	CSNK1A1	P48729	337 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	RUNX1	Q01196	453 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	PHF19	Q5T6S3	580 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	MFRP	Q9BY79	579 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	DVL1	O14640	695 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	HSD17B6	O14756	317 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	NKX2-2	O95096	273 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	IAPP	P10997	89 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	PDCD1	Q15116	288 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	SMIM8	Q96KF7	97 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	LYRM4	Q9HD34	91 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	IGHG1	P01857	330 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	HTR5A	P47898	357 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	P2RY1	P47900	373 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	SRPX	P78539	464 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	BIVM	Q86UB2	503 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PXN-222	ENST00000637624	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		10.77	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms