RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 A0A096LPE4 126 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 A0A1W2PPZ6 126 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 ARGFXA6NJG6 315 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 I3L521 148 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 AANATQ16613 207 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 ZNF766Q5HY98 468 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 ALKAL2Q6UX46 152 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 PIP4P1Q86T03 277 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 FAAP24Q9BTP7 215 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 PFDN2Q9UHV9 154 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 SESN1Q9Y6P5 492 aa16.03■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 MYO7BQ6PIF6 2116 aa16.02■□□□□ 0.16
CLN8-211ENST00000636934 C5orf49A4QMS7 147 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A10PA6NDY2 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A18PA6NE21 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A16PA6NEW6 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A7PA6NKC0 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A22PA8MWA6 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A12PA8MX19 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PRSS44E7EML9 344 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 HLA-HP01893 362 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A15PP0C7V4 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A13PP0C7W8 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A14PP0C7W9 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM90A24PP0C7X0 464 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 CD79AP11912 226 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 C9orf135Q5VTT2 229 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 SAXO1Q8IYX7 474 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FBXL14Q8N1E6 418 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 OR5M9Q8NGP3 310 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 ST8SIA2Q92186 375 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 SLC25A32Q9H2D1 315 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 ST3GAL6Q9Y274 331 aa16.02■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 ZNF850A8MQ14 1090 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 SHOXO15266 292 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PDCD6O75340 191 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 CST4P01036 141 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 NMBP08949 121 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 CCNOP22674 350 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PDZD9Q8IXQ8 264 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 MEMO1Q9Y316 297 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 ZNF175Q9Y473 711 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.01■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 SPDEFO95238 335 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 IGKV1D-12P01611 117 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 FCGR3AP08637 254 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 OR5H8P0DN80 308 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 GLRA1P23415 457 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PRSS12P56730 875 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 RBM11P57052 281 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 RAB1AP62820 205 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 BAMBIQ13145 260 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 OR10AD1Q8NGE0 317 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 OR56B2PQ8NGI1 322 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PHYHIPLQ96FC7 376 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 SULT4A1Q9BR01 284 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 ZNF286AQ9HBT8 521 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 DECR2Q9NUI1 292 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 MBD2Q9UBB5 411 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 NCOR1O75376 2440 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 RNF222A6NCQ9 220 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 IFNA2P01563 188 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PET100P0DJ07 73 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PI3P19957 117 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 PRDX4Q13162 271 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 SGPP2Q8IWX5 399 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 ZNF611Q8N823 705 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 Q8NFD4 153 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 WDYHV1Q96HA8 205 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 C1orf123Q9NWV4 160 aa16■□□□□ 0.15
CLN8-211ENST00000636934 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms