RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 TBCCD1Q9NVR7 557 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP13Q9UII6 198 aa20.33■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 C5orf63A6NC05 138 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SULT1B1O43704 296 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 UPK1BO75841 260 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 PAHP00439 452 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TUSC1Q2TAM9 212 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ALKBH6Q3KRA9 238 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 PTX4Q96A99 478 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SRRQ9GZT4 340 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 LIN7BQ9HAP6 207 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHA1Q9HB21 404 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5V1Q9UGF6 321 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BSH0 61 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FSHBP01225 129 aa20.31■□□□□ 0.84
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR8B8Q15620 311 aa20.31■□□□□ 0.84
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CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2NLQ5JXB2 153 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 AVPI1Q5T686 147 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 HES5Q5TA89 166 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM131AQ6UXB0 335 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A28Q96A46 364 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A7Q99884 636 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST5Q9GZS9 411 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 NEK6Q9HC98 313 aa20.31■□□□□ 0.84
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CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf100A8MU93 164 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM25AB3EWG3 89 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM25CB3EWG5 89 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM25GB3EWG6 89 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC14BO60729 498 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF250P15622 560 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBG1P23258 451 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVS71-1P61550 626 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF79Q15937 498 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 PRR31Q5SQ13 230 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM42Q69YG0 159 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5H6Q8NGV6 325 aa20.3■□□□□ 0.84
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CAPNS1-216ENST00000628306 TAAR3PQ9P1P4 343 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 OPN4Q9UHM6 478 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR2CP28335 458 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL8P80075 99 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM3AP98173 230 aa20.29■□□□□ 0.84
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CAPNS1-216ENST00000628306 OR51A2Q8NGJ7 313 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5L1Q8NGL2 311 aa20.29■□□□□ 0.84
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CAPNS1-216ENST00000628306 TECTBQ96PL2 329 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNG2Q9Y698 323 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEB3O15480 346 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV2-5P01817 119 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM157BP0CG42 384 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 MNDAP41218 407 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GSK3AP49840 483 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D28Q2M2D7 210 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf174Q8IYL3 243 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC30A7Q8NEW0 376 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM3DQ96BQ1 224 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.28■□□□□ 0.84
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CAPNS1-216ENST00000628306 PIGLQ9Y2B2 252 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS2O15393 492 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL2P13500 99 aa20.27■□□□□ 0.84
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CAPNS1-216ENST00000628306 IFITM3Q01628 133 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF92Q03936 586 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GFOD2Q3B7J2 385 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM255AQ5JRV8 349 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 OR13C9Q8NGT0 318 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 SPSB1Q96BD6 273 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 HAVCR1Q96D42 359 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 JMJD8Q96S16 334 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 GHRLQ9UBU3 117 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-216ENST00000628306 NKPD1Q17RQ9 610 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52N4Q8NGI2 321 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 SUCNR1Q9BXA5 334 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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