RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	MMP23A	O75900	390 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT6A	P02538	564 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TK1	P04183	234 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT6B	P04259	564 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	ACADS	P16219	412 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	EDN2	P20800	178 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TFPI2	P48307	235 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT6C	P48668	564 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB7A	P51149	207 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SFXN5	Q8TD22	340 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0J9YXV3	536 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	S1PR2	O95136	353 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT3	O95989	172 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	AGR2	O95994	175 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	NEFH	P12036	1026 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SOAT1	P35610	550 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX1	Q13596	522 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CLINT1	Q14677	625 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TSSK3	Q96PN8	268 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	MBOAT4	Q96T53	435 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SOCS1	O15524	211 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC22B	O75396	215 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CLU	P10909	449 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	C2orf54	Q08AI8	447 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	AQP6	Q13520	282 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR4	Q16378	134 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51I1	Q9H343	314 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SNAP23-223	ENST00000627440	C12orf10	Q9HB07	376 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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