RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CD28P10747 220 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 MPZP25189 248 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 PLA1AQ53H76 456 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 OXLD1Q5BKU9 147 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 OR4S1Q8NGB4 309 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 GPR173Q9NS66 373 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 OR14J1Q9UGF5 321 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 A6NDX4 124 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 K7N7A8 449 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 PIPP12273 146 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ASRGL1Q7L266 308 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 BATF2Q8N1L9 274 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 MALSU1Q96EH3 234 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 MMP28Q9H239 520 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 V9GYS6 101 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ODF3BA8MYP8 253 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ARG1P05089 322 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ERVK11-1P61568 191 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFA11Q86Y39 141 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 OR14K1Q8NGZ2 314 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 RPS4Y2Q8TD47 263 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GTI1 187 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 RBP4P02753 201 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ESRRGP62508 458 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 SSX2Q16385 188 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZSR3 168 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM219Q86XT9 240 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 OR11H6Q8NGC7 330 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 OR13D1Q8NGV5 346 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 APOL4Q9BPW4 351 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 PITPNC1Q9UKF7 332 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 A6NIN4 97 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 DHRS7CA6NNS2 312 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF728P0DKX0 622 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 CRISP1P54107 249 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 COL10A1Q03692 680 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF626Q68DY1 528 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ANGPTL5Q86XS5 388 aa20.09■□□□□ 0.81
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PTPRF-216ENST00000617451 R3HDM4Q96D70 268 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 OR4F4Q96R69 305 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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PTPRF-216ENST00000617451 PKIBQ9C010 78 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS22Q9GZN4 317 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 WNT10AQ9GZT5 417 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJB9Q9UBS3 223 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 OR52A1Q9UKL2 312 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A13Q9Y226 551 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 R4GMQ9 66 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 PRKYO43930 277 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF737O75373 536 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ALX3O95076 343 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 CXCR4P61073 352 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 IL24Q13007 206 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 MRAPQ8TCY5 172 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 NECAP2Q9NVZ3 263 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
PTPRF-216ENST00000617451 CHRM2P08172 466 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV1-8P0DP01 117 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 DYNLT3P51808 116 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 LOXL3P58215 753 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 ACTR3P61158 418 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 EDDM3BP56851 147 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 CBX1P83916 185 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZS46 218 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35F2Q8IXU6 374 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 SGCDQ92629 289 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 OR5M11Q96RB7 305 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 MNTQ99583 582 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRF-216ENST00000617451 DSCAML1Q8TD84 2053 aa20.06■□□□□ 0.8
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