RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598444.1

ARHGEF1-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARHGEF1, Length 425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1-215ENST00000598444 CIB1Q99828 191 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 SSX3Q99909 188 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 ADI1Q9BV57 179 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 PPA2Q9H2U2 334 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 C16orf95Q9H693 158 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 A0A1W2PPE2 198 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 A0A1W2PR64 198 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 A0A1W2PRV1 198 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 METTL15A6NJ78 407 aa7.22□□□□□ -1.25
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ARHGEF1-215ENST00000598444 H3BUX3 64 aa7.22□□□□□ -1.25
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ARHGEF1-215ENST00000598444 TSPAN9O75954 239 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR2T7P0C7T2 308 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 FCGR1AP12314 374 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 HTR1FP30939 366 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 ATP6V1E1P36543 226 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 LGALS4P56470 323 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 ERVFRD-1P60508 538 aa7.22□□□□□ -1.25
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ARHGEF1-215ENST00000598444 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 Q6ZSR3 168 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 CALHM1Q8IU99 346 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 RORBQ92753 470 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 UBE2FQ969M7 185 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.22□□□□□ -1.25
ARHGEF1-215ENST00000598444 K7N7A8 449 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SULT1C4O75897 302 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 INMTO95050 263 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SERPINA3P01011 423 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TK1P04183 234 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CCL3L1P16619 93 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CCL1P22362 96 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 MPZP25189 248 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PAX6P26367 422 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 FUT6P51993 359 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ERVK11-1P61568 191 aa7.21□□□□□ -1.26
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ARHGEF1-215ENST00000598444 UBE2V2Q15819 145 aa7.21□□□□□ -1.26
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ARHGEF1-215ENST00000598444 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 EME1Q96AY2 570 aa7.21□□□□□ -1.26
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ARHGEF1-215ENST00000598444 OSBPL10Q9BXB5 764 aa7.21□□□□□ -1.26
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ARHGEF1-215ENST00000598444 MMP27Q9H306 513 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 HES4Q9HCC6 221 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 USE1Q9NZ43 259 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.21□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.2□□□□□ -1.26
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ARHGEF1-215ENST00000598444 BMXP51813 675 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CDC42P60953 191 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 COL10A1Q03692 680 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TMED1Q13445 227 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF273Q14593 569 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 TP53I3Q53FA7 332 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 RDH10Q8IZV5 341 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 RFKQ969G6 155 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 SLAMF9Q96A28 289 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 BORCS8Q96FH0 119 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 CEP19Q96LK0 163 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF1-215ENST00000598444 GNG8Q9UK08 70 aa7.2□□□□□ -1.26
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