RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	PXT1	Q8NFP0	134 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CEP19	Q96LK0	163 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	LURAP1	Q96LR2	239 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.42	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CD37	P11049	281 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SERPINA2	P20848	420 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	GLRA1	P23415	457 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	PMEL	P40967	661 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RORC	P51449	518 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	GMFB	P60983	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CARTPT	Q16568	116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM166A	Q6J272	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256		Q8IYB0	196 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	POC1A	Q8NBT0	407 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF488	Q96MN9	340 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	GSX2	Q9BZM3	304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.41	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SRRM5	B3KS81	715 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	SSX4	O60224	188 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	KDM4B	O94953	1096 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	NXPH2	O95156	264 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	HTR3B	O95264	441 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	BPNT1	O95861	308 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	UBB	P0CG47	229 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	ARSB	P15848	533 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	EGR1	P18146	543 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	BCL3	P20749	454 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	COL8A2	P25067	703 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CFP	P27918	469 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CD80	P33681	288 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CAPZA1	P52907	286 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	GPR176	Q14439	515 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DGUOK	Q16854	277 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CDH24	Q86UP0	819 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	NINJ1	Q92982	152 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CST11	Q9H112	138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	GHRL	Q9UBU3	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	NPTN	Q9Y639	398 aa		13.4	□□□□□ -0.26
LTBP4-222	ENST00000598256	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A0B4J203	849 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM127	O75204	238 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	RP2	O75695	350 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	PAX1	P15863	534 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	CFHR2	P36980	270 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	NPBWR2	P48146	333 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF525	Q8N782	197 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	AP3S1	Q92572	193 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM46B	Q96A09	425 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.39	□□□□□ -0.27
LTBP4-222	ENST00000598256	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27

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