RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.5□□□□□ -1.53
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SMAD4-212ENST00000591126 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-212ENST00000591126 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-212ENST00000591126 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-212ENST00000591126 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-212ENST00000591126 IL36GQ9NZH8 169 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-212ENST00000591126 DOCK5Q9H7D0 1870 aa5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-212ENST00000591126 A8MV72 311 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SMAD4-212ENST00000591126 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.48□□□□□ -1.53
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