RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF75AQ96N20 296 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC38A2Q96QD8 506 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SYT4Q9H2B2 425 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RERGLQ9H628 205 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 YY1AP1Q9H869 796 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 MOKQ9UQ07 419 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 AP4S1Q9Y587 144 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 E7EQL1 145 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 DCTN6O00399 190 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 BHLHE40O14503 412 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SSX5O60225 188 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 MGRN1O60291 552 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC16A7O60669 478 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ATP6V1G1O75348 118 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RAB36O95755 333 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 TXNDC12O95881 172 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 IGKV3-15P01624 115 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV1-44P01699 117 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CBR1P16152 277 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A16P16260 332 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 LAP3P28838 519 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 OR3A3P47888 321 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 DSCR9P59020 149 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 NAAAQ02083 359 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ATP6AP1Q15904 470 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 GSG1Q2KHT4 349 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 THEM4Q5T1C6 240 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SSX8Q7RTT4 187 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 FBXO17Q96EF6 278 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 C4orf45Q96LM5 186 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RBP7Q96R05 134 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 NMNAT3Q96T66 252 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ASCL2Q99929 193 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 IL20Q9NYY1 176 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 TGP01266 2768 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PS18 150 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 H3BN98 237 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ARPC3O15145 178 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 LMX1BO60663 402 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 UBL3O95164 117 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 MPZL1O95297 269 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CD8AP01732 235 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 NR2C1P13056 603 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CCL2P13500 99 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF32P17041 273 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 HNF1AP20823 631 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 GSTM3P21266 225 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CA6P23280 308 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 IGFBP5P24593 272 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 FASP25445 335 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ARR3P36575 388 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 PITPNBP48739 271 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 DAPP51397 102 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 TAF13Q15543 124 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SLC36A2Q495M3 483 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 LIPNQ5VXI9 398 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
ATG4D-210ENST00000588972 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms