RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	RAB11B	Q15907	218 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	ELP2	Q6IA86	826 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	RNF144B	Q7Z419	303 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691		Q8NFD4	153 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	CEP19	Q96LK0	163 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	ING4	Q9UNL4	249 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	USF3	Q68DE3	2245 aa		14.16	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	SRRM5	B3KS81	715 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	NDUFS7	O75251	213 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	RHBDL1	O75783	438 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	BPNT1	O95861	308 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	OR3A4P	P47883	348 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	SCAND1	P57086	179 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	ERVK11-1	P61568	191 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	RSU1	Q15404	277 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	AWAT2	Q6E213	333 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	CDH24	Q86UP0	819 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	LRRC29	Q8WV35	223 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	YIPF5	Q969M3	257 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	SLC25A28	Q96A46	364 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	POM121	Q96HA1	1249 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		14.15	□□□□□ -0.14
TBCD-223	ENST00000576691	CLDN25	C9JDP6	229 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	NDUFS8	O00217	210 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	SSX4	O60224	188 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	PLAT	P00750	562 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	ARSB	P15848	533 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	GIF	P27352	417 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	SOX6	P35712	828 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	PDLIM4	P50479	330 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	SPCS2	Q15005	226 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	NDNF	Q8TB73	568 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	RAB1C	Q92928	201 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	SLAMF9	Q96A28	289 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	PERP	Q96FX8	193 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	TIMD4	Q96H15	378 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	CST11	Q9H112	138 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	HES4	Q9HCC6	221 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	CACNG2	Q9Y698	323 aa		14.14	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	DYSF	O75923	2080 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	PPIAL4D	F5H284	164 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	AKR7A2	O43488	359 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	ANGPTL7	O43827	346 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	LY6H	O94772	140 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	NXPH2	O95156	264 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV1D-12	P01611	117 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	CALCB	P10092	127 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	GLRA1	P23415	457 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	KCNJ8	Q15842	424 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	FAM189A2	Q15884	450 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	DGUOK	Q16854	277 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	HES5	Q5TA89	166 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	TREM2	Q9NZC2	230 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		14.13	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	LGALS8	O00214	317 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	NDUFA2	O43678	99 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	LYNX1	P0DP58	116 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	GTF2F2	P13984	249 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	BCL3	P20749	454 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	NPBWR2	P48146	333 aa		14.12	□□□□□ -0.15
TBCD-223	ENST00000576691	CAV3	P56539	151 aa		14.12	□□□□□ -0.15

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