RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556374.5

ATXN3-241, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-241ENST00000556374 BCKDHBP21953 392 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZBTB25P24278 435 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CD27P26842 260 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MST1P26927 711 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PSMB6P28072 239 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 LAP3P28838 519 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 HRH1P35367 487 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SERPINF1P36955 418 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ATP1B3P54709 279 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 BIDP55957 195 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 S100A10P60903 97 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 HSF1Q00613 529 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 NAAAQ02083 359 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 FOXF1Q12946 379 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PLA2G7Q13093 441 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TWIST1Q15672 202 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TSC22D1Q15714 1073 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C3orf36Q3SXR2 165 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 VAX1Q5SQQ9 334 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C1orf189Q5VU69 101 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 FAM166AQ6J272 317 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 COX15Q7KZN9 410 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 LINC00346Q8IVM7 164 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 KDM8Q8N371 416 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF321PQ8N8H1 164 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 OR51A2Q8NGJ7 313 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 GPR119Q8TDV5 335 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 RNF133Q8WVZ7 376 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 AQP3Q92482 292 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SLC25A28Q96A46 364 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 FGGYQ96C11 551 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C8orf44Q96CB5 159 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 RAB3CQ96E17 227 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 WBP1Q96G27 269 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PGAM5Q96HS1 289 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SEC22AQ96IW7 307 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PTDSS2Q9BVG9 487 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 NMES1Q9C002 83 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SHARPINQ9H0F6 387 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 RAB18Q9NP72 206 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MMP26Q9NRE1 261 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 GHRLQ9UBU3 117 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 IL17BQ9UHF5 180 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SLC45A2Q9UMX9 530 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 VSIG4Q9Y279 399 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 WIF1Q9Y5W5 379 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 FBN3Q75N90 2809 aa3.85□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 OR2W5A6NFC9 320 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 LMO7DNF2Z398 122 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 H3BML4 177 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SULT2B1O00204 365 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 LDLRAD4O15165 306 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 NPIPB7O75200 414 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ATG12O94817 140 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SFT2D2O95562 160 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PMP2P02689 132 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CRHP06850 196 aa3.84□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 GP1BAP07359 652 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms