RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 BORCS8Q96FH0 119 aa15.11■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 CHST5Q9GZS9 411 aa15.11■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 H0YAE9 185 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 J3QLW9 94 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 J3QRE1 110 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 NPFFO15130 113 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 HTR1AP08908 422 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF19P17023 458 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF91Q05481 1191 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 IL24Q13007 206 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 NCR3LG1Q68D85 454 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 SHISA2Q6UWI4 295 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 C10orf35Q96D05 121 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 LGALS12Q96DT0 336 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 SLC29A1Q99808 456 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 MPZL2O60487 215 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 INMTO95050 263 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 BAG2O95816 211 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 IGHV4-59P01825 116 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 FBP1P09467 338 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF20P17024 532 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 ACTA2P62736 377 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 ACTG2P63267 376 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 ENTHD1Q8IYW4 607 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 PNKDQ8N490 385 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 SGMS2Q8NHU3 365 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 PP6455Q8WZ26 134 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 TNFRSF14Q92956 283 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 SLAMF9Q96A28 289 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 C4orf36Q96KX1 117 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 CEP19Q96LK0 163 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 Q96MT0 163 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 HES4Q9HCC6 221 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 FRRS1LQ9P0K9 344 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
NEDD1-208ENST00000555806 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 MEIOCA2RUB1 952 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 PAHP00439 452 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 KNG1P01042 644 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 GABRB1P18505 474 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 RAG2P55895 527 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ERVK11-1P61568 191 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 RPL31P62899 125 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 SLC25A26Q70HW3 274 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 OR5D13Q8NGL4 314 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 OR4F5Q8NH21 305 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ALG8Q9BVK2 526 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 DPAGT1Q9H3H5 408 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 AMBNQ9NP70 447 aa15.08■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 A0A1W2PPH5 198 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 BTBD17A6NE02 478 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 POM121CA8CG34 1229 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ANGPTL7O43827 346 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 OCM2P0CE71 109 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 SAA4P35542 130 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 IER3P46695 156 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 POU3F4P49335 361 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 UBE2E1P51965 193 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ATP1B3P54709 279 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 FDX2Q6P4F2 183 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 LHFPL3Q86UP9 236 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 DYRK2Q92630 601 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 STMN2Q93045 179 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 FGGYQ96C11 551 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 PELI1Q96FA3 418 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 MTCH1Q9NZJ7 389 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 C1RLQ9NZP8 487 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ZNRD1Q9P1U0 126 aa15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 GPR137BO60478 399 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 FADS2O95864 444 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 CYB5AP00167 134 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 TK1P04183 234 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ISG15P05161 165 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 PIPP12273 146 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ATF1P18846 271 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 RBP2P50120 134 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 CCR9P51686 369 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 COL10A1Q03692 680 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 GALEQ14376 348 aa15.06■□□□□ 0
NEDD1-208ENST00000555806 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms