RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCKP27707 260 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSPA13P48723 471 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PROK1P58294 105 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSNK2BP67870 215 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP78Q5JTW2 689 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR86Q86TI4 376 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRSS35Q8N3Z0 413 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LY6G5BQ8NDX9 201 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF671Q8TAW3 534 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPRL2Q8WTW4 380 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GGHQ92820 318 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALG8Q9BVK2 526 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FKBP14Q9NWM8 211 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC22A13Q9Y226 551 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.97■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0G2JK05 382 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NKX6-3A6NJ46 265 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR37O15354 613 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERPINA3P01011 423 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPSAP08865 295 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL1P22362 96 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TAF9Q16594 264 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VMO1Q7Z5L0 202 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PELI1Q96FA3 418 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL13Q99616 98 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC7A11Q9UPY5 501 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 V9GYS6 101 aa15.96■□□□□ 0.15
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IRGMA1A4Y4 181 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XPNPEP2O43895 674 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GATBO75879 557 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ODF4Q2M2E3 257 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM76BQ5HYJ3 339 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR38Q5JTN6 314 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM244Q5VVB8 128 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF573Q86YE8 665 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDZD9Q8IXQ8 264 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C4orf36Q96KX1 117 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB26Q9ULW5 256 aa15.95■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTR1AP08908 422 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBP1P09467 338 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIR3DL2P43630 455 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ETV1P50549 477 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF485Q8NCK3 441 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2G2Q8NGZ5 317 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C10orf35Q96D05 121 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM80Q96HE8 168 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR51I2Q9H344 312 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C16orf95Q9H693 158 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRRS1LQ9P0K9 344 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ONECUT1Q9UBC0 465 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.94■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EFCAB10A6NFE3 127 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD61A6NGH8 418 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 J3QLW9 94 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFB3O43676 98 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF19P17023 458 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TGM4P49221 684 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCR9P51686 369 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GMFBP60983 142 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GUCA2AQ02747 115 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ST3GAL4Q11206 333 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED21Q13503 144 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q6ZSV7 163 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGFRL1Q8N441 504 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNTTIP1Q9H147 329 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR173Q9NS66 373 aa15.93■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1B0GW55 424 aa15.92■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa15.92■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTBD17A6NE02 478 aa15.92■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC1A7O00341 560 aa15.92■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ISG15P05161 165 aa15.92■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.92■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.92■□□□□ 0.14
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms