RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555557.5

SRP54-208, Transcript of signal recognition particle 54, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54, Length 1,949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-208ENST00000555557 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 UBBP0CG47 229 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 MGMTP16455 207 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 TALDO1P37837 337 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 ZNF45Q02386 682 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 ZNF846Q147U1 533 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 PDCD1Q15116 288 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 MUC15Q8N387 334 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 PXT1Q8NFP0 134 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 CMTM3Q96MX0 182 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 OR2V2Q96R30 315 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 ABHD1Q96SE0 405 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 SOSTQ9BQB4 213 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 GHRLQ9UBU3 117 aa8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SRP54-208ENST00000555557 TMEM210A6NLX4 147 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 AKR7A2O43488 359 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 CLDN1O95832 211 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 RAB6AP20340 208 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 PITPNBP48739 271 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 VEGFCP49767 419 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 CCL8P80075 99 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 IL24Q13007 206 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 PIGYQ3MUY2 71 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 MKXQ8IYA7 352 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 SPERTQ8NA61 448 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 PTX4Q96A99 478 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 CST11Q9H112 138 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 TREM2Q9NZC2 230 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 A6NNC1 897 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 C17orf100A8MU93 164 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 J3QT63 122 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 M0R233 179 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 SOCS1O15524 211 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 CYB5AP00167 134 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 GTF2F2P13984 249 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 MPZP25189 248 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 CD200P41217 278 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 CAPZA1P52907 286 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 PPP5CP53041 499 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 OXA1LQ15070 435 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 TAF9Q16594 264 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 PYDC2Q56P42 97 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 PHF21AQ96BD5 680 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 PKIBQ9C010 78 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 SRRQ9GZT4 340 aa8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 B9A039 149 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 RAB27BO00194 218 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 XRCC3O43542 346 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 HLA-DQB1P01920 261 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 GABRR1P24046 479 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 DUSP1P28562 367 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 PMELP40967 661 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 PTH2RP49190 550 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 TAS2R20P59543 309 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 EFNB3Q15768 340 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 KCNJ8Q15842 424 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 BAK1Q16611 211 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 WDR82Q6UXN9 313 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.63□□□□□ -1.03
SRP54-208ENST00000555557 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.63□□□□□ -1.03
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