RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	GCM1	Q9NP62	436 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	CRYBA1	P05813	215 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	GPR50	Q13585	617 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TPBG	Q13641	420 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	MPPED2	Q15777	294 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	UBE2V2	Q15819	145 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	CEP78	Q5JTW2	689 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	MOB3C	Q70IA8	216 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	WDR86	Q86TI4	376 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ERGIC1	Q969X5	290 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	MGLL	Q99685	303 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	MICU1	Q9BPX6	476 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	CHST5	Q9GZS9	411 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	SRRM5	B3KS81	715 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	IFNL4	K9M1U5	179 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ZNF205	O95201	554 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PLAT	P00750	562 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	GRP	P07492	148 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ZNF20	P17024	532 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PMEL	P40967	661 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	GPM6A	P51674	278 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PROK1	P58294	105 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PAX8	Q06710	450 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222		Q8TCH9	128 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	RNF170	Q96K19	258 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TECTB	Q96PL2	329 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	MRI1	Q9BV20	369 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	GPR173	Q9NS66	373 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	DHDH	Q9UQ10	334 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TMEM210	A6NLX4	147 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PPIAL4D	F5H284	164 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	NDUFA7	O95182	113 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	SERPINA3	P01011	423 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	OCM2	P0CE71	109 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	CPE	P16870	476 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	GNG3	P63215	75 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	UFD1	Q92890	307 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TMEM106A	Q96A25	262 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GUS0	222 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ZNF732	B4DXR9	585 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	TMEM178B	H3BS89	294 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	CD2	P06729	351 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	SOX2	P48431	317 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	FUT6	P51993	359 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	LOXL3	P58215	753 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	PAX2	Q02962	417 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222		Q499Y3	187 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	ZNF529	Q6P280	563 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-231	ENST00000552222	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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